RNA–Protein interactions for RNA: YKR021W

ALY1, Transcript of Alpha arrestin, substrate of calcineurin, yeast

Gene ALY1, Length 2,748 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALY1	YKR021W	HAT2	P39984	401 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	IRC15	Q02733	499 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YDR387C	Q04162	555 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	VPS54	Q12071	889 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MED2	Q12124	431 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	TSC11	P40061	1430 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	BRF1	P29056	596 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ATS1	P31386	333 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RIM2	P38127	377 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PCA1	P38360	1216 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CUL3	P53202	744 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	OCA2	P53949	197 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DCS1	Q06151	350 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DCI1	Q08558	271 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	NUP170	P38181	1502 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SWH1	P35845	1188 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RRT5	P43607	289 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PHO86	P46956	311 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GWT1	P47026	490 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YLR456W	Q06199	204 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SOR2	Q07786	357 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MTR10	Q99189	972 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MMS1	Q06211	1407 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	EXO70	P19658	623 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CTR86	P25355	563 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ECM25	P32525	599 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	FRE2	P36033	711 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PES4	P39684	611 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YGL082W	P53155	381 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YGR016W	P53209	190 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PEX25	Q02969	394 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	VPS74	Q06385	345 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	AEP3	Q12089	606 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DRS2	P39524	1355 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	TRM3	Q07527	1436 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	IKS1	P47042	667 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	AFT2	Q08957	416 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	BUD3	P25558	1636 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ANP1	P32629	500 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	REC114	P32841	428 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MMS4	P38257	691 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YHR054C	P38780	354 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RPR2	P40571	144 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YPS6	P40583	537 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RTT101	P47050	842 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MPS1	P54199	764 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PNG1	Q02890	363 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	NDL1	Q06568	189 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RMD5	Q12508	421 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ITR1	P30605	584 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CBP4	P37267	147 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	BZZ1	P38822	633 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MLH1	P38920	769 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	STN1	P38960	494 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YJL055W	P47044	245 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MLC1	P53141	149 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	TAF12	Q03761	539 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ULS1	Q08562	1619 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SPC110	P32380	944 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	NDC1	P32500	655 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	FAD1	P38913	306 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YAL037W	P39728	267 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YJL070C	P40361	888 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	COS10	P52924	374 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YIP1	P53039	248 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PCP1	P53259	346 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DSL1	P53847	754 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ODC1	Q03028	310 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	NUP53	Q03790	475 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ICT1	Q12385	394 aa		2.62	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms