RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNA10Q16322 511 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPTC7Q8NI37 304 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AFG1LQ8WV93 481 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA33Q96N06 139 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF577Q9BSK1 485 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PHF24Q9UPV7 400 aa27.21■■□□□ 1.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.2■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MMP3P08254 477 aa27.2■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SDF4Q9BRK5 362 aa27.2■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MSH4O15457 936 aa27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC37A4O43826 429 aa27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STX6O43752 255 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAPN15O75808 1086 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ASGR1P07306 291 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL6A1P12109 1028 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRAPPC10P48553 1259 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACLYP53396 1101 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NECAB2Q7Z6G3 386 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C11orf49Q9H6J7 331 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.18■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WNT7AO00755 349 aa27.17■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UIMC1Q96RL1 719 aa27.17■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27.17■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.17■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MTMR6Q9Y217 621 aa27.17■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYL3P08590 195 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP2B1P20020 1258 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SP4Q02446 784 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DGKDQ16760 1214 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ETNPPLQ8TBG4 499 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC5A5Q92911 643 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPR20Q99678 358 aa27.16■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A1W2PQY0 241 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KPNA6O60684 536 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PURAQ00577 322 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC38Q5R3I4 469 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BRAPQ7Z569 592 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POTEDQ86YR6 584 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FERMT2Q96AC1 680 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNMB3Q9NPA1 279 aa27.15■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBX3O15119 743 aa27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CABYRO75952 493 aa27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FERMT3Q86UX7 667 aa27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RIT2Q99578 217 aa27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.14■■□□□ 1.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEMFO60524 1076 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPFIA4O75335 1185 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRCH2Q5VUJ6 765 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM20AQ96MK3 541 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TEKT3Q9BXF9 490 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.13■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GAS7O60861 476 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MCM7P33993 719 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KRT76Q01546 638 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RESTQ13127 1097 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF174Q15697 407 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GJA10Q969M2 543 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STARD7Q9NQZ5 370 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ELP1O95163 1332 aa27.12■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PSMD10O75832 226 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACTR2P61160 394 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NBR1Q14596 966 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CALCRLQ16602 461 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HAS1Q92839 578 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.11■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MARCH6O60337 910 aa27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCNE2O96020 404 aa27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LGALS2P05162 132 aa27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF286BP0CG31 522 aa27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLFN12Q8IYM2 578 aa27.1■■□□□ 1.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms