RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429679.1

TMEM225B-201, Transcript of transmembrane protein 225B, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM225B, Length 482 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225B-201ENST00000429679 PDE4BQ07343 736 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PDE4DQ08499 809 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PTK7Q13308 1070 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 RNF135Q8IUD6 432 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 EDAQ92838 391 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 TIGD1Q96MW7 591 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 SAMD11Q96NU1 681 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CLDND1Q9NY35 253 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 STX8Q9UNK0 236 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 FAM50BQ9Y247 325 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 F2P00734 622 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CHMP4BP1P59074 171 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PPARAQ07869 468 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 HYAL1Q12794 435 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 GPM6BQ13491 265 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 LY6KQ17RY6 165 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 FBXO11Q86XK2 927 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 TMEM192Q8IY95 271 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 DCAF4Q8WV16 495 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 TOP1MTQ969P6 601 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 INCENPQ9NQS7 918 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CACNA1AO00555 2505 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 TMEM221A6NGB7 291 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 M0R296 226 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 NCK2O43639 380 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 GH1P01241 217 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 AMHP03971 560 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 HOXC8P31273 242 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PSEN2P49810 448 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 FOXK2Q01167 660 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ANKRD7Q92527 254 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 EMSYQ7Z589 1322 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 GFRA3O60609 400 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 HMMRO75330 724 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 EYA4O95677 639 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 APPP05067 770 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 FGRP09769 529 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ZNF286BP0CG31 522 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 MFSD10Q14728 455 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CLUL1Q15846 466 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 DGKDQ16760 1214 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 CCDC96Q2M329 555 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 SERINC5Q86VE9 423 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 C7orf31Q8N865 590 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 YME1L1Q96TA2 773 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 PRRX2Q99811 253 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 COL20A1Q9P218 1284 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.47□□□□□ -0.89
TMEM225B-201ENST00000429679 TSPY2A6NKD2 308 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 STXBP3O00186 592 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 GRM6O15303 877 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 LINC01565O15544 149 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 TPM3P06753 285 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 SNHG28P0DPA3 235 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 PDHBP11177 359 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 ZXDAP98168 799 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 CAMK1Q14012 370 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 PKN1Q16512 942 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.46□□□□□ -0.9
TMEM225B-201ENST00000429679 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms