RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 NEMFO60524 1076 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 MSCO60682 206 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 BEX3Q00994 111 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 GH1P01241 217 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 NEDD9Q14511 834 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.16■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 CTAGE5O15320 804 aa25.15■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 ADAMTS4O75173 837 aa25.15■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 SGPL1O95470 568 aa25.15■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 AFG1LQ8WV93 481 aa25.15■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.15■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC5A5Q92911 643 aa25.14■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 SPATA33Q96N06 139 aa25.14■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.14■■□□□ 1.62
SOHLH1-201ENST00000298466 GJA9P57773 515 aa25.14■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CALCRLQ16602 461 aa25.14■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 METTL7BQ6UX53 244 aa25.14■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.14■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 PTGDRQ13258 359 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 SDF4Q9BRK5 362 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 Q9Y3F1 56 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CLIC4Q9Y696 253 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 GJA8P48165 433 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 LAMC2Q13753 1193 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 GNASQ5JWF2 1037 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 MTMR9Q96QG7 549 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.13■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 MARCH6O60337 910 aa25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 PSMD10O75832 226 aa25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CCNE2O96020 404 aa25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 LRRC41Q15345 812 aa25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 USP28Q96RU2 1077 aa25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 GAS7O60861 476 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TXKP42681 527 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 SPC25Q9HBM1 224 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 NFASCO94856 1347 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CHMP2AO43633 222 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.11■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 A6NJR5 290 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 NUCB2P80303 420 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 KCNA10Q16322 511 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 PPTC7Q8NI37 304 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM20AQ96MK3 541 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 RIT2Q99578 217 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 GPR20Q99678 358 aa25.1■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TBX3O15119 743 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 MMP3P08254 477 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 RNF180Q86T96 592 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 OR52Z1P0C646 297 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 ACTR2P61160 394 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 VAV3Q9UKW4 847 aa25.09■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 CPT1AP50416 773 aa25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.08■■□□□ 1.61
SOHLH1-201ENST00000298466 SOX10P56693 466 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 NKX3-2P78367 333 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 IL17AQ16552 155 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 ASGR1P07306 291 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF286BP0CG31 522 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 TECP42680 631 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.07■■□□□ 1.6
SOHLH1-201ENST00000298466 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.07■■□□□ 1.6
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