RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A PGA3Q12746 312 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A TY4B-JP47024 1803 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A GDH1P07262 454 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A ATR1P13090 542 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A MCK1P21965 375 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SPB1P25582 841 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A BUB3P26449 341 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RAD14P28519 371 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A ERG3P32353 365 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A NPL6P32832 435 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A PMU1P36069 295 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A HAT2P39984 401 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A FAU1P40099 211 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A ALG8P40351 577 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A POP1P41812 875 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A ELP2P42935 788 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A GWT1P47026 490 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YLR287CQ05881 355 aa3.5□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A HEM2P05373 342 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RHO2P06781 192 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A AFG1P32317 509 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A JNM1P36224 373 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A KRE9P39005 276 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YGR149WP48236 432 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
YLR347W-AYLR347W-A SCM3Q12334 223 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RRD2Q12461 358 aa3.49□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A AGA1P32323 725 aa3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A TUL1P36096 758 aa3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A CBP4P37267 147 aa3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YOL159C-AQ3E769 90 aa3.48□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SPS4P09937 338 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A ATP10P18496 279 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A GYP6P32806 458 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RGT1P32862 1170 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SOV1Q04748 898 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A VTA1Q06263 330 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SFI1Q12369 946 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A CTF3Q12748 733 aa3.47□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YIL177CP40434 1758 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A YJL225CP40889 1758 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A PPH22P23595 377 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A CLB3P24870 427 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RNA14P25298 677 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A NFU1P32860 256 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A SAS3P34218 831 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A FRE2P36033 711 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RSM22P36056 628 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A THI2P38141 450 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A YHR218WP38899 603 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A GCD10P41814 478 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A TFG2P41896 400 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A IDP2P41939 412 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A ARK1P53974 638 aa3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A CPR3P25719 182 aa3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A YIM1P28625 365 aa3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A VTC2P43585 828 aa3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A YJL132WP47014 750 aa3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A MNP1P53163 194 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A NCS2P53923 493 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A PSK1P31374 1356 aa3.45□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A CLC1P17891 233 aa3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A NDI1P32340 513 aa3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A REC114P32841 428 aa3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A NIP100P33420 868 aa3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A GPD2P41911 440 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A WSC2P53832 503 aa3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A PRP21P32524 280 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A HCS1P34243 683 aa3.43□□□□□ -1.86
YLR347W-AYLR347W-A YBP1P38315 674 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 188.2 ms