RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SPS4	P09937	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PMR1	P13586	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	CDC23	P16522	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SPR1	P32603	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	KDX1	P36005	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MSR1	P38714	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RCY1	P39531	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	FMC1	P40491	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SWP82	P43554	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BNA6	P43619	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	AIM22	P47051	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	VOA1	P53262	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YGR127W	P53275	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	CAB5	Q03941	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	NDL1	Q06568	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	CRT10	Q08226	957 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	NRT1	Q08485	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	TGS1	Q12052	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	VAM3	Q12241	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	JIP3	O13555	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ERG11	P10614	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	WHI2	P12611	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PMA2	P19657	947 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	IMG1	P25626	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RAD14	P28519	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ITR1	P30605	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	HIR2	P32480	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ERG7	P38604	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YHR182W	P38870	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	OTU1	P43558	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RET3	P53600	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	OCA2	P53949	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YML122C	Q03207	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	APC4	Q04601	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	FMP16	Q12497	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ECM25	P32525	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PTR3	P43606	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YNL146W	P53906	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ESBP6	P53918	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SRL4	Q03085	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	COQ11	Q05892	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RTT109	Q07794	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BTS1	Q12051	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BAG7	Q12128	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RRD2	Q12461	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	CDC21	P06785	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PUT2	P07275	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PEP5	P12868	1029 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	CYM1	P32898	989 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YKL071W	P36086	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YPT10	P38146	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ICS2	P38284	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SDH8	P38345	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ATM1	P40416	690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	TAX4	P47030	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ROG1	P53118	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BNA7	Q04066	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	IPK1	Q06667	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ALG1	P16661	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YSP3	P25036	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MGR1	P25573	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SIP1	P32578	815 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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