RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ERLIN2-209	ENST00000521993		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SGSM2	O43147	1006 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	NCK2	O43639	380 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PDHB	P11177	359 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PSEN2	P49810	448 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	STXBP2	Q15833	593 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TTC14	Q96N46	770 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	LCT	P09848	1927 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993		H3BNC9	293 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZP2	Q05996	745 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	GPM6B	Q13491	265 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MFSD10	Q14728	455 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	HAS3	O00219	553 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	FOXP2	O15409	715 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	F2	P00734	622 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ALX1	Q15699	326 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	USH1G	Q495M9	461 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNX27	Q96L92	541 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	YME1L1	Q96TA2	773 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PSMA5	P28066	241 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	KRT32	Q14532	448 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SEPT8	Q92599	483 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ABCB11	O95342	1321 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PTPRS	Q13332	1948 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	THPO	P40225	353 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	TBC1D5	Q92609	795 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	WNT8B	Q93098	351 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	CLDND1	Q9NY35	253 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERLIN2-209	ENST00000521993	SI	P14410	1827 aa		11.47	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms