RNA–Protein interactions for RNA: YBR049C

REB1, Transcript of RNA polymerase I enhancer binding protein, yeast

Gene REB1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REB1	YBR049C	CHS1	P08004	1131 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	KIN3	P22209	435 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MRP20	P32387	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YBL010C	P32788	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SPO23	P33757	523 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YHL017W	P38745	532 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	LNP1	P38878	278 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YER085C	P40058	173 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	THI6	P41835	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	OTU1	P43558	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	LIF1	P53150	421 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	RUB1	Q03919	77 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MFB1	Q04922	465 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	BBP1	Q12365	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SET6	Q12529	373 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	STE12	P13574	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	COT1	P32798	439 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	FCY21	P40039	528 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YIL089W	P40500	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GTO1	P48239	356 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SLI1	P53304	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	DIA1	P54005	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	RAD30	Q04049	632 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	IZH3	Q07959	543 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	HER1	Q12276	1246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GCN4	P03069	281 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	PCT1	P13259	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	CTR86	P25355	563 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	BOS1	P25385	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GID7	P25569	745 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GEX1	P25596	615 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	IMG1	P25626	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	FUN26	P31381	517 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SRB2	P34162	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GCS1	P35197	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MYO3	P36006	1272 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	HEL1	P36113	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	CTP1	P38152	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MRX3	P38172	270 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
REB1	YBR049C	ATM1	P40416	690 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	HPM1	P40481	377 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GAB1	P41733	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	FMS1	P50264	508 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MRK1	P50873	501 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	DSD1	P53095	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	RIM8	P53179	542 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	TAM41	P53230	385 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	TMA10	Q06177	86 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	VPS74	Q06385	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	MUM3	Q08750	479 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	NUS1	Q12063	375 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GET4	Q12125	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	INP53	Q12271	1107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GRX6	Q12438	231 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	RTN2	Q12443	393 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	ARP6	Q12509	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SNT2	P53127	1403 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GAL4	P04386	881 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	CBS1	P14066	229 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	ABF1	P14164	731 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	PRE8	P23639	250 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YCR061W	P25639	631 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	DAD2	P36162	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	PPS1	P38148	807 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
REB1	YBR049C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	VAB2	P40003	282 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REB1	YBR049C	YMR134W	P40207	237 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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