RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 TMEM240Q5SV17 173 aa30.88■■■□□ 2.53
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ODC1-204ENST00000446285 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
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ODC1-204ENST00000446285 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.87■■■□□ 2.53
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ODC1-204ENST00000446285 SLC12A7Q9Y666 1083 aa30.84■■■□□ 2.53
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ODC1-204ENST00000446285 ACRP10323 421 aa30.82■■■□□ 2.52
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ODC1-204ENST00000446285 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
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ODC1-204ENST00000446285 TIFAQ96CG3 184 aa30.75■■■□□ 2.51
ODC1-204ENST00000446285 SCLYQ96I15 445 aa30.75■■■□□ 2.51
ODC1-204ENST00000446285 SPATA33Q96N06 139 aa30.75■■■□□ 2.51
ODC1-204ENST00000446285 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
ODC1-204ENST00000446285 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
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ODC1-204ENST00000446285 CHMP4BP1P59074 171 aa30.74■■■□□ 2.51
ODC1-204ENST00000446285 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
ODC1-204ENST00000446285 MICU3Q86XE3 530 aa30.74■■■□□ 2.51
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