RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W CYC3P06182 269 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PEP4P07267 405 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W ART10P18634 518 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PWP1P21304 576 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SPS22P25380 463 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W BUB3P26449 341 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W IES6P32617 166 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W REC114P32841 428 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W NUP133P36161 1157 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RIB5P38145 238 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YBR225WP38321 900 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SPO73P40031 143 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DLD2P46681 530 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CPR7P47103 393 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DIA3P52290 468 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YGR126WP53274 230 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YDR239CQ03780 787 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PLP2Q12017 286 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W APC2Q12440 853 aa0.1□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TPK1P06244 397 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MSS18P08593 268 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SST2P11972 698 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PUP3P25451 205 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YCR100CP25606 316 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W POP5P28005 173 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PDB1P32473 366 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W KAR9P32526 644 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W AGA2P32781 87 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W CYM1P32898 989 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RSM22P36056 628 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TCM62P38228 572 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W IST3P40565 148 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PTR3P43606 678 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TRS85P46944 698 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YPS5P53057 165 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PIL1P53252 339 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MDG1P53885 366 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TGL2P54857 326 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ODC1Q03028 310 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YDR061WQ12298 539 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RAD61Q99359 647 aa0.09□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MES1P00958 751 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W LEU4P06208 619 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SAG1P20840 650 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ADH7P25377 361 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W BOS1P25385 244 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W DPH2P32461 534 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W HEL1P36113 551 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W IFA38P38286 347 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YGP1P38616 354 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NPR3P38742 1146 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YNG2P38806 282 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W BAT1P38891 393 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ISC1P40015 477 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ALD5P40047 520 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SEC9P40357 651 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W VPS4P52917 437 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PAP2P53632 584 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PNG1Q02890 363 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PPM1Q04081 328 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W LIP2Q06005 328 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SKG3Q06315 1026 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W IZH2Q12442 317 aa0.08□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W IMG1P25626 169 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ITR1P30605 584 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RML2P32611 393 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MFT1P33441 392 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W BNA4P38169 460 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RTC2P38279 296 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ICS2P38284 255 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W STP2P38704 541 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W WSS1P38838 269 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MST28P39552 234 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YER184CP39961 794 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SLZ1P40167 298 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PSF2P40359 213 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YFL012WP43580 148 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YGL262WP53054 175 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W EFM6P53970 246 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YPL107WQ02873 248 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRP51Q02950 344 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MUB1Q03162 620 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TFC6Q06339 672 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PSR1Q07800 427 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W THP1Q08231 455 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NUS1Q12063 375 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MPD2Q99316 277 aa0.07□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SUI2P20459 304 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
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