RNA–Protein interactions for RNA: YPL119C

DBP1, Transcript of Putative ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family, yeast

Gene DBP1, Length 1,854 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DBP1	YPL119C	YCR087C-A	P37263	153 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	COS111	P38308	924 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YHL012W	P38709	493 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	APE4	P38821	490 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	GAB1	P41733	394 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YJR030C	P47101	745 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	FLC3	P53121	802 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MPS1	P54199	764 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YDR239C	Q03780	787 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RAD7	P06779	565 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MET8	P15807	274 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	DMC1	P25453	334 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	BCK2	P33306	851 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	INM1	P38710	295 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SER33	P40510	469 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YGR015C	P53208	328 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SPR6	Q01684	191 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	EMI1	Q04406	187 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MLH3	Q12083	715 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CNA1	P23287	553 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	GMH1	P36125	273 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SOL2	P37262	315 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	ATG7	P38862	630 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	ERV46	P39727	415 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YJL070C	P40361	888 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MDM34	P53083	459 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MON1	P53129	644 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YNL140C	P53910	189 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	AAT1	Q01802	451 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	PML39	Q03760	334 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	NDL1	Q06568	189 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	TYR1	P20049	452 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CLB3	P24870	427 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CTR86	P25355	563 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YBR138C	P38277	524 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RIC1	P40395	1056 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YJR149W	P47177	404 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YNR068C	P53754	272 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	IRC15	Q02733	499 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CCE1	Q03702	353 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YHM2	Q04013	314 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RAD30	Q04049	632 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YOL131W	Q08270	108 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RSA1	Q08932	381 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MHF2	Q3E829	80 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	DCW1	P36091	449 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	GLG1	P36143	616 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YBR285W	P38354	144 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.24	□□□□□ -0.93	not detected
DBP1	YPL119C	AIM22	P47051	409 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SWI5	P08153	709 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	UNG1	P12887	359 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CLN2	P20438	545 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	HXT4	P32467	576 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SEC17	P32602	292 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	TFB1	P32776	642 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	ECM4	P36156	370 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	IML3	P38265	245 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	HXT7	P39004	570 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	PFA3	P42836	336 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MPS2	P53159	387 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SMP3	Q04174	516 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	DAP2	P18962	818 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MAC1	P35192	417 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	LAS21	P40367	830 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	VHS1	Q03785	461 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	MFG1	Q07684	458 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	ATG10	Q07879	167 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	SGO1	Q08490	590 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	TRM8	Q12009	286 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	VIK1	Q12045	647 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	RAP1	P11938	827 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	PMT1	P33775	817 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DBP1	YPL119C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93

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