RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	PIG1	Q06216	648 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YDL218W	Q07629	317 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PFA4	Q12006	378 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PSY3	Q12318	242 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MTR10	Q99189	972 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	CBP1	P07252	654 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ATP10	P18496	279 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	DAP2	P18962	818 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MSN2	P33748	704 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PIM1	P36775	1133 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YHR210C	P38893	341 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PAC2	P39937	518 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	IRC7	P43623	340 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PIB2	P53191	635 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ATP23	P53722	227 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ARP10	Q04549	284 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SWF1	Q04629	336 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MCP2	Q06567	569 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	BSP1	Q06604	576 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
YMR31	YFR049W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YPR089W	O13585	888 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PEP5	P12868	1029 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PMR1	P13586	950 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RHB1	P25378	209 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YEL043W	P32618	956 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	REC114	P32841	428 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MRPL4	P36517	319 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	CBP4	P37267	147 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ARP1	P38696	384 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RRF1	P38771	230 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PCL7	P40186	285 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	OSW5	P40219	148 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	VHS2	P40463	436 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	NAS2	P40555	220 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	HXT9	P40885	567 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ECM27	P47144	725 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YNR068C	P53754	272 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	AQR1	P53943	586 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SLG1	P54867	378 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YPL014W	Q02606	381 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	IRC10	Q08118	586 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
YMR31	YFR049W	UBX3	Q12229	455 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	HER1	Q12276	1246 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MDY2	Q12285	212 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RRI1	Q12468	440 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YLR111W	Q12528	110 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	EDE1	P34216	1381 aa		2.59	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	RIP1	P08067	215 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	TYR1	P20049	452 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	KRE2	P27809	442 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	PPZ2	P33329	710 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	HOT13	P36078	116 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	DUG2	P38149	878 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	LAG1	P38703	411 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	YER130C	P39959	443 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	CHS6	P40955	746 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	VPS25	P47142	202 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	YIP5	P53108	310 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	PKP2	P53170	491 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	SLI1	P53304	468 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	SOL4	P53315	255 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	RIP-Chip
YMR31	YFR049W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	YNL234W	P53857	426 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	RBA50	Q04418	439 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	SSK1	Q07084	712 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	YOR365C	Q08844	703 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	PNS1	Q12412	539 aa		2.58	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	BAR1	P12630	587 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	ADY2	P25613	283 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	COQ3	P27680	312 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	SNC1	P31109	117 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	SIN4	P32259	974 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	ATP11	P32453	318 aa		2.57	□□□□□ -2
YMR31	YFR049W	SCO2	P38072	301 aa		2.57	□□□□□ -2

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