RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 BACE1P56817 501 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CCL15Q16663 113 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MMP19Q99542 508 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 GUCY1A2P33402 732 aa9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 METTL13Q8N6R0 699 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 GTF2A2P52657 109 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 NEK11Q8NG66 645 aa9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.19□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 WDR64B1ANS9 1081 aa9.18□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 GNA14O95837 355 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 HACE1Q8IYU2 909 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CHST13Q8NET6 341 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 NEK9Q8TD19 979 aa9.18□□□□□ -0.94
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