RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ANKRD28-203ENST00000439830 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
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ANKRD28-203ENST00000439830 C16orf59Q7L2K0 433 aa29.39■■■□□ 2.3
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ANKRD28-203ENST00000439830 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ANKRD28-203ENST00000439830 TBC1D5Q92609 795 aa29.39■■■□□ 2.3
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ANKRD28-203ENST00000439830 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
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ANKRD28-203ENST00000439830 IL23AQ9NPF7 189 aa29.38■■■□□ 2.29
ANKRD28-203ENST00000439830 COL20A1Q9P218 1284 aa29.38■■■□□ 2.29
ANKRD28-203ENST00000439830 EYSQ5T1H1 3165 aa29.38■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
ANKRD28-203ENST00000439830 ERICH2A1L162 156 aa29.36■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 DNAJB2P25686 324 aa29.36■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 A6NJR5 290 aa29.35■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 CFBP00751 764 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKRD28-203ENST00000439830 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKRD28-203ENST00000439830 GRM4Q14833 912 aa29.34■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 STXBP2Q15833 593 aa29.34■■■□□ 2.29
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ANKRD28-203ENST00000439830 HERVK_113Q902F9 699 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 PXMP2Q9NR77 195 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 OPLAHO14841 1288 aa29.31■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
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ANKRD28-203ENST00000439830 MAP4K1Q92918 833 aa29.3■■■□□ 2.28
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ANKRD28-203ENST00000439830 NR3C2P08235 984 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 TROAPQ12815 778 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKRD28-203ENST00000439830 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.28■■■□□ 2.28
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ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF576Q9H609 170 aa29.28■■■□□ 2.28
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