RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426827.5

TTLL3-208, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 756 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-208	ENST00000426827	GPNMB	Q14956	572 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	NFIB	O00712	420 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	EFCAB14	O75071	495 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	GJB5	O95377	273 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	MAF1	Q9H063	256 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	APP	P05067	770 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	SELP	P16109	830 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	SNAP25	P60880	206 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	GJD3	Q8N144	294 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	RAD9A	Q99638	391 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	NAPB	Q9H115	298 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-208	ENST00000426827	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ALAD	P13716	330 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	DEFB103A	P81534	67 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	PTGIS	Q16647	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827		B4DLN1	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	FGR	P09769	529 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	PDE4D	Q08499	809 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	FOXP2	O15409	715 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ORC4	O43929	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	NBN	O60934	754 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ARIH2	O95376	493 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	MMP3	P08254	477 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	KAT2B	Q92831	832 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	COPS5	Q92905	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	NMT2	O60551	498 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	CKB	P12277	381 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	IL9	P15248	144 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	MRE11	P49959	708 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-208	ENST00000426827	DCX	O43602	365 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms