RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIN3	YOL004W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SIN3	YOL004W	STB3	Q12427	513 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SIN3	YOL004W	PAH1	P32567	862 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SIN3	YOL004W	MAL31	P38156	614 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	PAF1	P38351	445 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	MSM1	P22438	575 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	GRX6	Q12438	231 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	RIA1	P53893	1110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CTH1	P47976	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	LDH1	P38139	375 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CKB1	P43639	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
SIN3	YOL004W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	NYV1	Q12255	253 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	POM152	P39685	1337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CST9	Q06032	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	IRC3	Q06683	689 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CSE1	P33307	960 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CRF1	Q04930	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	MSB4	Q12317	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	CLA4	P48562	842 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SIN3	YOL004W	HXT5	P38695	592 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	YAF9	P53930	226 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	TIM50	Q02776	476 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	AFG2	P32794	780 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	SIR4	P11978	1358 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	IPL1	P38991	367 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	NST1	P53935	1240 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	MDG1	P53885	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	GAL2	P13181	574 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	TOP1	P04786	769 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	RAD9	P14737	1309 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	SGD1	Q06132	899 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SIN3	YOL004W	JIP4	Q03361	876 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	ATG1	P53104	897 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	IRE1	P32361	1115 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	YKL133C	P36066	463 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	SHC1	P39000	512 aa		4	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	PSF2	P40359	213 aa		4	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	MLP2	P40457	1679 aa		4	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	PDR12	Q02785	1511 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	SPT21	P35209	758 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	MAM3	Q12296	706 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	PEA2	P40091	420 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	PUS6	P53294	404 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	RLF2	Q12495	606 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	SPR3	P41901	512 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	UBX2	Q04228	584 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	RBA50	Q04418	439 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	CLB5	P30283	435 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	IOC3	P43596	787 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	POL1	P13382	1468 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	CAT8	P39113	1433 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	AHC1	Q12433	566 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	IDI1	P15496	288 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	DSF2	P38213	736 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SIN3	YOL004W	SSP1	P38871	571 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SIN3	YOL004W	FIR1	P40020	876 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SIN3	YOL004W	IFH1	P39520	1085 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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