RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	21.98	■■□□□ 1.11
BBS1-225	ENST00000630659	NAIP	Q13075	1403 aa		21.96	■■□□□ 1.11
BBS1-225	ENST00000630659	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		21.95	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	21.95	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	AKNA	Q7Z591	1439 aa		21.93	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		21.93	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	DAPK1	P53355	1430 aa		21.92	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		21.92	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		21.92	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	MAPKBP1	O60336	1514 aa		21.91	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		21.91	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	ABCC5	O15440	1437 aa		21.9	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		21.9	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		21.89	■■□□□ 1.1
BBS1-225	ENST00000630659	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		21.89	■■□□□ 1.09
BBS1-225	ENST00000630659	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		21.88	■■□□□ 1.09
BBS1-225	ENST00000630659	ROCK1	Q13464	1354 aa		21.86	■■□□□ 1.09
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	21.85	■■□□□ 1.09
BBS1-225	ENST00000630659	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		21.85	■■□□□ 1.09
BBS1-225	ENST00000630659	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
BBS1-225	ENST00000630659	PREX2	Q70Z35	1606 aa		21.78	■■□□□ 1.08
BBS1-225	ENST00000630659	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		21.77	■■□□□ 1.08
BBS1-225	ENST00000630659	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	21.77	■■□□□ 1.08
BBS1-225	ENST00000630659	KDM6B	O15054	1643 aa		21.76	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		21.76	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		21.75	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		21.75	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRL2	O95490	1459 aa		21.74	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	KCNH8	Q96L42	1107 aa		21.72	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	NCOA1	Q15788	1441 aa		21.72	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		21.71	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		21.71	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		21.71	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM52	Q96A61	297 aa		21.7	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		21.7	■■□□□ 1.07
BBS1-225	ENST00000630659	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		21.7	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		21.69	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		21.69	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		21.68	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	MBD5	Q9P267	1494 aa		21.68	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	21.67	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		21.67	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	TSPY4	P0CV99	314 aa		21.67	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	TSPY10	P0CW01	314 aa		21.67	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		21.66	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	PLCH2	O75038	1416 aa		21.64	■■□□□ 1.06
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		21.64	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		21.64	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		21.63	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		21.63	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		21.61	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		21.6	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		21.59	■■□□□ 1.05
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		21.58	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	21.57	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		21.56	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	ASXL2	Q76L83	1435 aa		21.56	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		21.55	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	KIF15	Q9NS87	1388 aa		21.54	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	TONSL	Q96HA7	1378 aa		21.53	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		21.53	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		21.52	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		21.52	■■□□□ 1.04
BBS1-225	ENST00000630659	PZP	P20742	1482 aa		21.51	■■□□□ 1.03
BBS1-225	ENST00000630659	ABCC1	P33527	1531 aa		21.51	■■□□□ 1.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		21.47	■■□□□ 1.03
BBS1-225	ENST00000630659	FOXD1	Q16676	465 aa		21.47	■■□□□ 1.03
BBS1-225	ENST00000630659	PLXNC1	O60486	1568 aa		21.46	■■□□□ 1.03
BBS1-225	ENST00000630659	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		21.44	■■□□□ 1.02
BBS1-225	ENST00000630659	FANCA	O15360	1455 aa		21.43	■■□□□ 1.02
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		21.43	■■□□□ 1.02
BBS1-225	ENST00000630659	NUP155	O75694	1391 aa		21.43	■■□□□ 1.02
BBS1-225	ENST00000630659	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		21.4	■■□□□ 1.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
BBS1-225	ENST00000630659	PKD2	Q13563	968 aa		21.39	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		21.39	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		21.37	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		21.36	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		21.36	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		21.36	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	NEFL	P07196	543 aa		21.35	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRL1	O94910	1474 aa		21.35	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	AFAP1	Q8N556	730 aa		21.34	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		21.34	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	UNC13B	O14795	1591 aa		21.34	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		21.33	■■□□□ 1.01
BBS1-225	ENST00000630659	CD109	Q6YHK3	1445 aa		21.33	■■□□□ 1
BBS1-225	ENST00000630659	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		21.33	■■□□□ 1
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
BBS1-225	ENST00000630659	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		21.31	■■□□□ 1
BBS1-225	ENST00000630659	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		21.31	■■□□□ 1
BBS1-225	ENST00000630659	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		21.31	■■□□□ 1
BBS1-225	ENST00000630659	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		21.31	■■□□□ 1

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