RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621489.1

AC245407.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC245407.1, Length 2,538 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC245407.1-201ENST00000621489 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.51□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 POLA2Q14181 598 aa7.51□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 GOLGA3Q08378 1498 aa7.51□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.51□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 FLIIQ13045 1269 aa7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF428Q96B54 188 aa7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 CFTRP13569 1480 aa7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 AK7Q96M32 723 aa7.5□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 SEMA3EO15041 775 aa7.49□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.48□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 KIF21BO75037 1637 aa7.48□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 PLEKHG5O94827 1062 aa7.47□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 TRAK2O60296 914 aa7.47□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.46□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 A6NJR5 290 aa7.46□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 CAPN15O75808 1086 aa7.46□□□□□ -1.21
AC245407.1-201ENST00000621489 GSE1Q14687 1217 aa7.45□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.45□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 SYNJ1O43426 1573 aa7.45□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 PRDM2Q13029 1718 aa7.44□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 CUX2O14529 1486 aa7.44□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 E9PSI1 815 aa7.44□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.42□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 STK24Q9Y6E0 443 aa7.42□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 WDR62O43379 1518 aa7.42□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 CLIP1P30622 1438 aa7.41□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.41□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.41□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.41□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.4□□□□□ -1.22
AC245407.1-201ENST00000621489 PDE4DQ08499 809 aa7.4□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 TRIM66O15016 1216 aa7.38□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 DSG3P32926 999 aa7.38□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 E2F4Q16254 413 aa7.38□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 FAM117AQ9C073 453 aa7.38□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.37□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 RETREG2Q8NC44 543 aa7.36□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 USP35Q9P2H5 1018 aa7.36□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.36□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 TOPBP1Q92547 1522 aa7.35□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 IRF5Q13568 498 aa7.35□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.34□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 TOP2BQ02880 1626 aa7.34□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 FBXW7Q969H0 707 aa7.34□□□□□ -1.23
AC245407.1-201ENST00000621489 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.33□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.33□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.32□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 CUX1P39880 1505 aa7.32□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.31□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 NUBP1P53384 320 aa7.31□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.31□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ARAP1Q96P48 1450 aa7.3□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.3□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.3□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.3□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.29□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.29□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ABCB7O75027 752 aa7.28□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AC245407.1-201ENST00000621489 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.27□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 PRXQ9BXM0 1461 aa7.27□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 GOPCQ9HD26 462 aa7.27□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 MCM6Q14566 821 aa7.27□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.27□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 IFT140Q96RY7 1462 aa7.26□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AC245407.1-201ENST00000621489 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms