RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609571.5

ATRNL1-209, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-209ENST00000609571 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
ATRNL1-209ENST00000609571 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.09■■■■■ 4.01
ATRNL1-209ENST00000609571 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.06■■■■■ 4
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
ATRNL1-209ENST00000609571 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.01■■■■■ 4
ATRNL1-209ENST00000609571 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.97■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.95■■■■□ 3.99
ATRNL1-209ENST00000609571 ADGRL2O95490 1459 aa39.91■■■■□ 3.98
ATRNL1-209ENST00000609571 PREX2Q70Z35 1606 aa39.89■■■■□ 3.98
ATRNL1-209ENST00000609571 KDM6BO15054 1643 aa39.88■■■■□ 3.98
ATRNL1-209ENST00000609571 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.88■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.86■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.82■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.81■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.8■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 NCOA1Q15788 1441 aa39.8■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.74■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.74■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 NEUROD1Q13562 356 aa39.72■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.71■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.71■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 TRIM52Q96A61 297 aa39.7■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.7■■■■□ 3.95
ATRNL1-209ENST00000609571 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 MBD5Q9P267 1494 aa39.68■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.68■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.66■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.64■■■■□ 3.94
ATRNL1-209ENST00000609571 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.62■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.62■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 TONSLQ96HA7 1378 aa39.59■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 TSPY4P0CV99 314 aa39.59■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 TSPY10P0CW01 314 aa39.59■■■■□ 3.93
ATRNL1-209ENST00000609571 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.57■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 PLCH2O75038 1416 aa39.54■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.54■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.53■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.52■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.52■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.52■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.51■■■■□ 3.92
ATRNL1-209ENST00000609571 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.49■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 KCNH8Q96L42 1107 aa39.48■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 PZPP20742 1482 aa39.47■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.47■■■■□ 3.91
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.42■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 KIF15Q9NS87 1388 aa39.41■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-209ENST00000609571 PLXNC1O60486 1568 aa39.36■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCC1P33527 1531 aa39.35■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.34■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.29■■■■□ 3.88
ATRNL1-209ENST00000609571 ASXL2Q76L83 1435 aa39.26■■■■□ 3.88
ATRNL1-209ENST00000609571 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.24■■■■□ 3.87
ATRNL1-209ENST00000609571 FOXD1Q16676 465 aa39.24■■■■□ 3.87
ATRNL1-209ENST00000609571 NUP155O75694 1391 aa39.21■■■■□ 3.87
ATRNL1-209ENST00000609571 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.18■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 UNC13BO14795 1591 aa39.16■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.14■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 PKD2Q13563 968 aa39.14■■■■□ 3.86
ATRNL1-209ENST00000609571 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.12■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 MIER1Q8N108 512 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 FANCAO15360 1455 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 ERBINQ96RT1 1412 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.11■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.1■■■■□ 3.85
ATRNL1-209ENST00000609571 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.06■■■■□ 3.84
ATRNL1-209ENST00000609571 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.01■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.01■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.96■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 ADGRL1O94910 1474 aa38.95■■■■□ 3.83
ATRNL1-209ENST00000609571 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP7AQ04656 1500 aa38.89■■■■□ 3.82
ATRNL1-209ENST00000609571 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.89■■■■□ 3.82
ATRNL1-209ENST00000609571 AFAP1Q8N556 730 aa38.88■■■■□ 3.81
ATRNL1-209ENST00000609571 CD109Q6YHK3 1445 aa38.84■■■■□ 3.81
ATRNL1-209ENST00000609571 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.79■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 DEPDC5O75140 1603 aa38.78■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.76■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP10AO60312 1499 aa38.76■■■■□ 3.8
ATRNL1-209ENST00000609571 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.76■■■■□ 3.79
ATRNL1-209ENST00000609571 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
ATRNL1-209ENST00000609571 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 235.9 ms