RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607547.2

U3.45-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 219 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.45-201ENST00000607547 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 MLECQ14165 292 aa6.12□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.12□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.12□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.12□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 STRCQ7RTU9 1775 aa6.11□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.11□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.1□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 CHIC1Q5VXU3 224 aa6.1□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 C3P01024 1663 aa6.1□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 KIF14Q15058 1648 aa6.1□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 ATP10AO60312 1499 aa6.09□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 ILDR2Q71H61 639 aa6.09□□□□□ -1.43
U3.45-201ENST00000607547 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.09□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.08□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.08□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 PTPRTO14522 1441 aa6.08□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 REREQ9P2R6 1566 aa6.07□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.07□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 KDM5CP41229 1560 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 MROH2AA6NES4 1674 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 PLCH2O75038 1416 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CLIP1P30622 1438 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 EEA1Q15075 1411 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 ABCA6Q8N139 1617 aa6.06□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.05□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.05□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.05□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 PREX2Q70Z35 1606 aa6.04□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.04□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 AGLP35573 1532 aa6.04□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.03□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 NCOA1Q15788 1441 aa6.03□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 FMN1Q68DA7 1419 aa6.03□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.03□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.03□□□□□ -1.44
U3.45-201ENST00000607547 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.02□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.02□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 ABCC1P33527 1531 aa6.02□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 NPATQ14207 1427 aa6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.01□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 PLA2R1Q13018 1463 aa6□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.99□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.99□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.99□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.98□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 PKD2Q13563 968 aa5.97□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 AFAP1Q8N556 730 aa5.97□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 CPS1P31327 1500 aa5.97□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.97□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
U3.45-201ENST00000607547 ATP7AQ04656 1500 aa5.96□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.96□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 PPP6R1Q9UPN7 881 aa5.96□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.96□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 PLXNC1O60486 1568 aa5.95□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.95□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa5.95□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 ZMYM3Q14202 1370 aa5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 TOM1O60784 492 aa5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 PIP4K2BP78356 416 aa5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 SYNMO15061 1565 aa5.93□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 PTPRKQ15262 1439 aa5.93□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 A2MP01023 1474 aa5.93□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.93□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.92□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.92□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 IQGAP1P46940 1657 aa5.91□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.91□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.91□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.91□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 HSPA1LP34931 641 aa5.91□□□□□ -1.46
U3.45-201ENST00000607547 DEPDC5O75140 1603 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms