RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602243.5

SAMD4B-212, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

TSL 3

Gene SAMD4B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-212ENST00000602243 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.36■■■■■ 4.21
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SAMD4B-212ENST00000602243 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.28■■■■■ 4.2
SAMD4B-212ENST00000602243 FMN1Q68DA7 1419 aa41.26■■■■■ 4.19
SAMD4B-212ENST00000602243 ATP10AO60312 1499 aa41.25■■■■■ 4.19
SAMD4B-212ENST00000602243 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.23■■■■■ 4.19
SAMD4B-212ENST00000602243 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.22■■■■■ 4.19
SAMD4B-212ENST00000602243 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.22■■■■■ 4.19
SAMD4B-212ENST00000602243 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
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SAMD4B-212ENST00000602243 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.17■■■■■ 4.18
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SAMD4B-212ENST00000602243 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.12■■■■■ 4.17
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SAMD4B-212ENST00000602243 CERKQ8TCT0 537 aa41.1■■■■■ 4.17
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SAMD4B-212ENST00000602243 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.08■■■■■ 4.17
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SAMD4B-212ENST00000602243 AFAP1Q8N556 730 aa41.02■■■■■ 4.16
SAMD4B-212ENST00000602243 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41■■■■■ 4.15
SAMD4B-212ENST00000602243 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.98■■■■■ 4.15
SAMD4B-212ENST00000602243 REREQ9P2R6 1566 aa40.94■■■■■ 4.14
SAMD4B-212ENST00000602243 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.93■■■■■ 4.14
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SAMD4B-212ENST00000602243 ABCA6Q8N139 1617 aa40.9■■■■■ 4.14
SAMD4B-212ENST00000602243 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.9■■■■■ 4.14
SAMD4B-212ENST00000602243 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.88■■■■■ 4.13
SAMD4B-212ENST00000602243 PREX2Q70Z35 1606 aa40.85■■■■■ 4.13
SAMD4B-212ENST00000602243 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.84■■■■■ 4.13
SAMD4B-212ENST00000602243 ABCC1P33527 1531 aa40.83■■■■■ 4.13
SAMD4B-212ENST00000602243 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.81■■■■■ 4.12
SAMD4B-212ENST00000602243 C3P01024 1663 aa40.81■■■■■ 4.12
SAMD4B-212ENST00000602243 AGLP35573 1532 aa40.8■■■■■ 4.12
SAMD4B-212ENST00000602243 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.79■■■■■ 4.12
SAMD4B-212ENST00000602243 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.77■■■■■ 4.12
SAMD4B-212ENST00000602243 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.75■■■■■ 4.11
SAMD4B-212ENST00000602243 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.73■■■■■ 4.11
SAMD4B-212ENST00000602243 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.71■■■■■ 4.11
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SAMD4B-212ENST00000602243 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.69■■■■■ 4.1
SAMD4B-212ENST00000602243 PTPRTO14522 1441 aa40.67■■■■■ 4.1
SAMD4B-212ENST00000602243 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.62■■■■■ 4.09
SAMD4B-212ENST00000602243 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.58■■■■■ 4.09
SAMD4B-212ENST00000602243 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.57■■■■■ 4.08
SAMD4B-212ENST00000602243 NCOA1Q15788 1441 aa40.53■■■■■ 4.08
SAMD4B-212ENST00000602243 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.52■■■■■ 4.08
SAMD4B-212ENST00000602243 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
SAMD4B-212ENST00000602243 MROH2AA6NES4 1674 aa40.51■■■■■ 4.08
SAMD4B-212ENST00000602243 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
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SAMD4B-212ENST00000602243 ZMYM3Q14202 1370 aa40.41■■■■■ 4.06
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SAMD4B-212ENST00000602243 ATP7AQ04656 1500 aa40.41■■■■■ 4.06
SAMD4B-212ENST00000602243 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.4■■■■■ 4.06
SAMD4B-212ENST00000602243 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
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SAMD4B-212ENST00000602243 A2MP01023 1474 aa40.32■■■■■ 4.04
SAMD4B-212ENST00000602243 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.31■■■■■ 4.04
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SAMD4B-212ENST00000602243 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.28■■■■■ 4.04
SAMD4B-212ENST00000602243 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.28■■■■■ 4.04
SAMD4B-212ENST00000602243 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.26■■■■■ 4.04
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SAMD4B-212ENST00000602243 PTPRKQ15262 1439 aa40.24■■■■■ 4.03
SAMD4B-212ENST00000602243 PLA2R1Q13018 1463 aa40.22■■■■■ 4.03
SAMD4B-212ENST00000602243 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
SAMD4B-212ENST00000602243 GGT6Q6P531 493 aa40.2■■■■■ 4.03
SAMD4B-212ENST00000602243 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.2■■■■■ 4.03
SAMD4B-212ENST00000602243 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
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SAMD4B-212ENST00000602243 TIAM1Q13009 1591 aa40.12■■■■■ 4.01
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SAMD4B-212ENST00000602243 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.02■■■■■ 4
SAMD4B-212ENST00000602243 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.02■■■■■ 4
SAMD4B-212ENST00000602243 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
SAMD4B-212ENST00000602243 CEP162Q5TB80 1403 aa39.97■■■■□ 3.99
SAMD4B-212ENST00000602243 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
SAMD4B-212ENST00000602243 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
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