RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592352.1

HSBP1L1-205, Transcript of heat shock factor binding protein 1 like 1, human

TSL 2

Gene HSBP1L1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HSBP1L1-205	ENST00000592352	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.09	■■■□□ 2.73
HSBP1L1-205	ENST00000592352	KIF14	Q15058	1648 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HSBP1L1-205	ENST00000592352	HSPA2	P54652	639 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ATP10A	O60312	1499 aa		32.07	■■■□□ 2.72
HSBP1L1-205	ENST00000592352	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HSBP1L1-205	ENST00000592352	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HSBP1L1-205	ENST00000592352	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MLEC	Q14165	292 aa		32.01	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	KDM5C	P41229	1560 aa		32.01	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.97	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.95	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.93	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.9	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.9	■■■□□ 2.7
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CLIP1	P30622	1438 aa		31.88	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.87	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.85	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.84	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.84	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.84	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
HSBP1L1-205	ENST00000592352	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.81	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ABCC1	P33527	1531 aa		31.81	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.8	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.78	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	AGL	P35573	1532 aa		31.78	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.77	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.76	■■■□□ 2.68
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.76	■■■□□ 2.67
HSBP1L1-205	ENST00000592352	C3	P01024	1663 aa		31.75	■■■□□ 2.67
HSBP1L1-205	ENST00000592352	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.74	■■■□□ 2.67
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.72	■■■□□ 2.67
HSBP1L1-205	ENST00000592352	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.71	■■■□□ 2.67
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.64	■■■□□ 2.66
HSBP1L1-205	ENST00000592352	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.63	■■■□□ 2.65
HSBP1L1-205	ENST00000592352	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.63	■■■□□ 2.65
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.61	■■■□□ 2.65
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PTPRT	O14522	1441 aa		31.59	■■■□□ 2.65
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.57	■■■□□ 2.64
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.54	■■■□□ 2.64
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.54	■■■□□ 2.64
HSBP1L1-205	ENST00000592352	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
HSBP1L1-205	ENST00000592352	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.5	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.49	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	NPAT	Q14207	1427 aa		31.48	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.47	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.45	■■■□□ 2.63
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.44	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.4	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.4	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.4	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.4	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
HSBP1L1-205	ENST00000592352	A2M	P01023	1474 aa		31.35	■■■□□ 2.61
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.33	■■■□□ 2.61
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.31	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.31	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.29	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.29	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.29	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.27	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.27	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.6
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.26	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.25	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.23	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.2	■■■□□ 2.59
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.58
HSBP1L1-205	ENST00000592352	GGT6	Q6P531	493 aa		31.18	■■■□□ 2.58
HSBP1L1-205	ENST00000592352	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HSBP1L1-205	ENST00000592352	PKD2	Q13563	968 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HSBP1L1-205	ENST00000592352	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.16	■■■□□ 2.58
HSBP1L1-205	ENST00000592352	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.12	■■■□□ 2.57
HSBP1L1-205	ENST00000592352	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
HSBP1L1-205	ENST00000592352	SOCS7	O14512	581 aa		31.11	■■■□□ 2.57
HSBP1L1-205	ENST00000592352	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
HSBP1L1-205	ENST00000592352	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.07	■■■□□ 2.56
HSBP1L1-205	ENST00000592352	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.04	■■■□□ 2.56

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