RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580738.5

NDEL1-209, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1 like 1, human

TSL 2

Gene NDEL1, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDEL1-209	ENST00000580738	PLCH2	O75038	1416 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NDEL1-209	ENST00000580738	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NDEL1-209	ENST00000580738	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.04	■■■□□ 2.72
NDEL1-209	ENST00000580738	ATP10A	O60312	1499 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NDEL1-209	ENST00000580738	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
NDEL1-209	ENST00000580738	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32	■■■□□ 2.71
NDEL1-209	ENST00000580738	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
NDEL1-209	ENST00000580738	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NDEL1-209	ENST00000580738	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.97	■■■□□ 2.71
NDEL1-209	ENST00000580738	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.95	■■■□□ 2.71
NDEL1-209	ENST00000580738	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NDEL1-209	ENST00000580738	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	KIF14	Q15058	1648 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.85	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.84	■■■□□ 2.69
NDEL1-209	ENST00000580738	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	KDM5C	P41229	1560 aa		31.8	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NDEL1-209	ENST00000580738	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NDEL1-209	ENST00000580738	CLIP1	P30622	1438 aa		31.73	■■■□□ 2.67
NDEL1-209	ENST00000580738	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.69	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.69	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.67	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.66	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.66	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.65	■■■□□ 2.66
NDEL1-209	ENST00000580738	C3	P01024	1663 aa		31.64	■■■□□ 2.65
NDEL1-209	ENST00000580738	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
NDEL1-209	ENST00000580738	PTPRT	O14522	1441 aa		31.63	■■■□□ 2.65
NDEL1-209	ENST00000580738	AGL	P35573	1532 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NDEL1-209	ENST00000580738	ABCC1	P33527	1531 aa		31.59	■■■□□ 2.65
NDEL1-209	ENST00000580738	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.57	■■■□□ 2.64
NDEL1-209	ENST00000580738	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.52	■■■□□ 2.64
NDEL1-209	ENST00000580738	SOCS7	O14512	581 aa		31.52	■■■□□ 2.64
NDEL1-209	ENST00000580738	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.52	■■■□□ 2.64
NDEL1-209	ENST00000580738	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.51	■■■□□ 2.64
NDEL1-209	ENST00000580738	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.49	■■■□□ 2.63
NDEL1-209	ENST00000580738	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.49	■■■□□ 2.63
NDEL1-209	ENST00000580738	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.49	■■■□□ 2.63
NDEL1-209	ENST00000580738	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.48	■■■□□ 2.63
NDEL1-209	ENST00000580738	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.45	■■■□□ 2.63
NDEL1-209	ENST00000580738	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
NDEL1-209	ENST00000580738	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.43	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.42	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.41	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.4	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.4	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	NPAT	Q14207	1427 aa		31.4	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.39	■■■□□ 2.62
NDEL1-209	ENST00000580738	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
NDEL1-209	ENST00000580738	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.38	■■■□□ 2.61
NDEL1-209	ENST00000580738	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.38	■■■□□ 2.61
NDEL1-209	ENST00000580738	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NDEL1-209	ENST00000580738	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
NDEL1-209	ENST00000580738	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.34	■■■□□ 2.61
NDEL1-209	ENST00000580738	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
NDEL1-209	ENST00000580738	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
NDEL1-209	ENST00000580738	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.31	■■■□□ 2.6
NDEL1-209	ENST00000580738	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.27	■■■□□ 2.6
NDEL1-209	ENST00000580738	GGT6	Q6P531	493 aa		31.25	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.24	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.24	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	A2M	P01023	1474 aa		31.24	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.24	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.23	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	PKD2	Q13563	968 aa		31.22	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.21	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.21	■■■□□ 2.59
NDEL1-209	ENST00000580738	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
NDEL1-209	ENST00000580738	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.19	■■■□□ 2.58
NDEL1-209	ENST00000580738	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.18	■■■□□ 2.58
NDEL1-209	ENST00000580738	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
NDEL1-209	ENST00000580738	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
NDEL1-209	ENST00000580738	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
NDEL1-209	ENST00000580738	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.11	■■■□□ 2.57
NDEL1-209	ENST00000580738	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.08	■■■□□ 2.57
NDEL1-209	ENST00000580738	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.05	■■■□□ 2.56
NDEL1-209	ENST00000580738	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.04	■■■□□ 2.56
NDEL1-209	ENST00000580738	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.04	■■■□□ 2.56
NDEL1-209	ENST00000580738	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
NDEL1-209	ENST00000580738	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
NDEL1-209	ENST00000580738	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
NDEL1-209	ENST00000580738	TIAM1	Q13009	1591 aa		31	■■■□□ 2.55
NDEL1-209	ENST00000580738	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		30.98	■■■□□ 2.55
NDEL1-209	ENST00000580738	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
NDEL1-209	ENST00000580738	HSPA1L	P34931	641 aa		30.97	■■■□□ 2.55

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