RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.84□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 POGKQ9P215 609 aa6.84□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 TOMM22Q9NS69 142 aa6.84□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.84□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 RFX1P22670 979 aa6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 NGEFQ8N5V2 710 aa6.82□□□□□ -1.32
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ZBED6-202ENST00000550078 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.82□□□□□ -1.32
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ZBED6-202ENST00000550078 CEP89Q96ST8 783 aa6.81□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 MTMR7Q9Y216 660 aa6.81□□□□□ -1.32
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ZBED6-202ENST00000550078 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.8□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.8□□□□□ -1.32
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ZBED6-202ENST00000550078 ARID3AQ99856 593 aa6.78□□□□□ -1.32
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ZBED6-202ENST00000550078 PSMD1Q99460 953 aa6.78□□□□□ -1.32
ZBED6-202ENST00000550078 USP35Q9P2H5 1018 aa6.78□□□□□ -1.32
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ZBED6-202ENST00000550078 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ZBED6-202ENST00000550078 E9PSI1 815 aa6.76□□□□□ -1.33
ZBED6-202ENST00000550078 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ZBED6-202ENST00000550078 FAM177BA6PVY3 158 aa6.75□□□□□ -1.33
ZBED6-202ENST00000550078 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.75□□□□□ -1.33
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ZBED6-202ENST00000550078 FYB1O15117 783 aa6.74□□□□□ -1.33
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ZBED6-202ENST00000550078 CRBNQ96SW2 442 aa6.73□□□□□ -1.33
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ZBED6-202ENST00000550078 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.66□□□□□ -1.34
ZBED6-202ENST00000550078 APPP05067 770 aa6.66□□□□□ -1.34
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ZBED6-202ENST00000550078 CSPG5O95196 566 aa6.65□□□□□ -1.34
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ZBED6-202ENST00000550078 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.64□□□□□ -1.35
ZBED6-202ENST00000550078 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.64□□□□□ -1.35
ZBED6-202ENST00000550078 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZBED6-202ENST00000550078 PLIN1O60240 522 aa6.63□□□□□ -1.35
ZBED6-202ENST00000550078 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
ZBED6-202ENST00000550078 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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