RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545774.5

MVK-211, Transcript of mevalonate kinase, human

TSL 3

Gene MVK, Length 702 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MVK-211	ENST00000545774	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.03	■■■■■ 4.48
MVK-211	ENST00000545774	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.01	■■■■■ 4.48
MVK-211	ENST00000545774	MLEC	Q14165	292 aa		43.01	■■■■■ 4.48
MVK-211	ENST00000545774	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	ATP10A	O60312	1499 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.95	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.95	■■■■■ 4.47
MVK-211	ENST00000545774	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.93	■■■■■ 4.46
MVK-211	ENST00000545774	KIF14	Q15058	1648 aa		42.89	■■■■■ 4.46
MVK-211	ENST00000545774	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.87	■■■■■ 4.45
MVK-211	ENST00000545774	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
MVK-211	ENST00000545774	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.87	■■■■■ 4.45
MVK-211	ENST00000545774	KDM5C	P41229	1560 aa		42.8	■■■■■ 4.44
MVK-211	ENST00000545774	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		42.8	■■■■■ 4.44
MVK-211	ENST00000545774	CLIP1	P30622	1438 aa		42.8	■■■■■ 4.44
MVK-211	ENST00000545774	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MVK-211	ENST00000545774	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.75	■■■■■ 4.43
MVK-211	ENST00000545774	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.75	■■■■■ 4.43
MVK-211	ENST00000545774	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MVK-211	ENST00000545774	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
MVK-211	ENST00000545774	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MVK-211	ENST00000545774	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MVK-211	ENST00000545774	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MVK-211	ENST00000545774	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MVK-211	ENST00000545774	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.63	■■■■■ 4.42
MVK-211	ENST00000545774	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
MVK-211	ENST00000545774	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MVK-211	ENST00000545774	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.58	■■■■■ 4.41
MVK-211	ENST00000545774	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MVK-211	ENST00000545774	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MVK-211	ENST00000545774	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MVK-211	ENST00000545774	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MVK-211	ENST00000545774	ABCC1	P33527	1531 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MVK-211	ENST00000545774	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MVK-211	ENST00000545774	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.53	■■■■■ 4.4
MVK-211	ENST00000545774	AGL	P35573	1532 aa		42.53	■■■■■ 4.4
MVK-211	ENST00000545774	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.52	■■■■■ 4.4
MVK-211	ENST00000545774	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.48	■■■■■ 4.39
MVK-211	ENST00000545774	C3	P01024	1663 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MVK-211	ENST00000545774	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
MVK-211	ENST00000545774	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MVK-211	ENST00000545774	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MVK-211	ENST00000545774	PTPRT	O14522	1441 aa		42.36	■■■■■ 4.37
MVK-211	ENST00000545774	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.36	■■■■■ 4.37
MVK-211	ENST00000545774	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.34	■■■■■ 4.37
MVK-211	ENST00000545774	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MVK-211	ENST00000545774	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.23	■■■■■ 4.35
MVK-211	ENST00000545774	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
MVK-211	ENST00000545774	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MVK-211	ENST00000545774	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MVK-211	ENST00000545774	NPAT	Q14207	1427 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MVK-211	ENST00000545774	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MVK-211	ENST00000545774	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
MVK-211	ENST00000545774	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.13	■■■■■ 4.34
MVK-211	ENST00000545774	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.13	■■■■■ 4.34
MVK-211	ENST00000545774	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.13	■■■■■ 4.33
MVK-211	ENST00000545774	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MVK-211	ENST00000545774	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MVK-211	ENST00000545774	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.1	■■■■■ 4.33
MVK-211	ENST00000545774	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
MVK-211	ENST00000545774	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.07	■■■■■ 4.33
MVK-211	ENST00000545774	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.06	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.06	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.05	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.02	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	A2M	P01023	1474 aa		42.02	■■■■■ 4.32
MVK-211	ENST00000545774	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
MVK-211	ENST00000545774	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.95	■■■■■ 4.31
MVK-211	ENST00000545774	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	ILDR2	Q71H61	639 aa		41.92	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.92	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.91	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	PLA2R1	Q13018	1463 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	GGT6	Q6P531	493 aa		41.89	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.89	■■■■■ 4.3
MVK-211	ENST00000545774	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
MVK-211	ENST00000545774	PKD2	Q13563	968 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MVK-211	ENST00000545774	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		41.84	■■■■■ 4.29
MVK-211	ENST00000545774	TIAM1	Q13009	1591 aa		41.82	■■■■■ 4.29
MVK-211	ENST00000545774	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.82	■■■■■ 4.29
MVK-211	ENST00000545774	MBD5	Q9P267	1494 aa		41.8	■■■■■ 4.28
MVK-211	ENST00000545774	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
MVK-211	ENST00000545774	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
MVK-211	ENST00000545774	SOCS7	O14512	581 aa		41.8	■■■■■ 4.28
MVK-211	ENST00000545774	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		41.79	■■■■■ 4.28
MVK-211	ENST00000545774	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.78	■■■■■ 4.28
MVK-211	ENST00000545774	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.72	■■■■■ 4.27
MVK-211	ENST00000545774	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
MVK-211	ENST00000545774	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		41.69	■■■■■ 4.26
MVK-211	ENST00000545774	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		41.66	■■■■■ 4.26
MVK-211	ENST00000545774	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.64	■■■■■ 4.26
MVK-211	ENST00000545774	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.59	■■■■■ 4.25

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