RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537529.6

MKS1-204, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-204ENST00000537529 KDM6BO15054 1643 aa22.51■■□□□ 1.19
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MKS1-204ENST00000537529 ATP10BO94823 1461 aa22.49■■□□□ 1.19
MKS1-204ENST00000537529 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MKS1-204ENST00000537529 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MKS1-204ENST00000537529 PTPRGP23470 1445 aa22.49■■□□□ 1.19
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MKS1-204ENST00000537529 TRIM52Q96A61 297 aa22.47■■□□□ 1.19
MKS1-204ENST00000537529 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
MKS1-204ENST00000537529 SHROOM2Q13796 1616 aa22.46■■□□□ 1.19
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MKS1-204ENST00000537529 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.27■■□□□ 1.16
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MKS1-204ENST00000537529 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.18■■□□□ 1.14
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MKS1-204ENST00000537529 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.16■■□□□ 1.14
MKS1-204ENST00000537529 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.16■■□□□ 1.14
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MKS1-204ENST00000537529 PLXNC1O60486 1568 aa22■■□□□ 1.11
MKS1-204ENST00000537529 CCER2I3L3R5 266 aa22■■□□□ 1.11
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MKS1-204ENST00000537529 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.95■■□□□ 1.1
MKS1-204ENST00000537529 UNC13BO14795 1591 aa21.95■■□□□ 1.1
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MKS1-204ENST00000537529 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.86■■□□□ 1.09
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MKS1-204ENST00000537529 USP47Q96K76 1375 aa21.81■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.8■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.8■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 27.4
MKS1-204ENST00000537529 KDM5CP41229 1560 aa21.78■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.78■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.77■■□□□ 1.08
MKS1-204ENST00000537529 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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