RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521591.5

TNIP1-211, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-211ENST00000521591 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TNIP1-211ENST00000521591 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TNIP1-211ENST00000521591 DAPK1P53355 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
TNIP1-211ENST00000521591 TRIM52Q96A61 297 aa24.74■■□□□ 1.55
TNIP1-211ENST00000521591 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.73■■□□□ 1.55
TNIP1-211ENST00000521591 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.73■■□□□ 1.55
TNIP1-211ENST00000521591 ABCC5O15440 1437 aa24.71■■□□□ 1.55
TNIP1-211ENST00000521591 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TNIP1-211ENST00000521591 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TNIP1-211ENST00000521591 ABCA8O94911 1581 aa24.64■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.63■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.63■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.62■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.59■■□□□ 1.53
TNIP1-211ENST00000521591 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.58■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 CHD1O14646 1710 aa24.57■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.56■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.56■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 KIF14Q15058 1648 aa24.55■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.55■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 MYT1Q01538 1121 aa24.54■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 ADGRL2O95490 1459 aa24.53■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 ATP10BO94823 1461 aa24.52■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TNIP1-211ENST00000521591 NCOA1Q15788 1441 aa24.51■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 FOXD1Q16676 465 aa24.51■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.5■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.5■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.5■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 PTPRGP23470 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 PZPP20742 1482 aa24.49■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 FKBP8Q14318 412 aa24.49■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 SHROOM2Q13796 1616 aa24.47■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 NEFLP07196 543 aa24.46■■□□□ 1.51
TNIP1-211ENST00000521591 CCDC7Q96M83 1385 aa24.45■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.44■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.44■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.43■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.42■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.42■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.41■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.4■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.39■■□□□ 1.5
TNIP1-211ENST00000521591 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TNIP1-211ENST00000521591 MBD5Q9P267 1494 aa24.38■■□□□ 1.49
TNIP1-211ENST00000521591 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TNIP1-211ENST00000521591 BCANQ96GW7 911 aa24.34■■□□□ 1.49
TNIP1-211ENST00000521591 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.33■■□□□ 1.49
TNIP1-211ENST00000521591 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
TNIP1-211ENST00000521591 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TNIP1-211ENST00000521591 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP1-211ENST00000521591 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.29■■□□□ 1.48
TNIP1-211ENST00000521591 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.28■■□□□ 1.48
TNIP1-211ENST00000521591 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.27■■□□□ 1.48
TNIP1-211ENST00000521591 PKD2Q13563 968 aa24.26■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.26■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 ABCC2Q92887 1545 aa24.26■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.25■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 PREX2Q70Z35 1606 aa24.24■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.23■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.22■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.21■■□□□ 1.47
TNIP1-211ENST00000521591 TSPY4P0CV99 314 aa24.2■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 TSPY10P0CW01 314 aa24.2■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 CCDC184Q52MB2 194 aa24.19■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 NUP155O75694 1391 aa24.19■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 USP47Q96K76 1375 aa24.19■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 KDM5CP41229 1560 aa24.19■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.17■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.16■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 MRS2Q9HD23 443 aa24.16■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.15■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 22.9
TNIP1-211ENST00000521591 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.15■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.15■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.462e-7■■■□□ 19.1
TNIP1-211ENST00000521591 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.14■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 KIF15Q9NS87 1388 aa24.14■■□□□ 1.46
TNIP1-211ENST00000521591 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.14■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.13■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.1■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.09■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.09■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TNIP1-211ENST00000521591 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.06■■□□□ 1.44
TNIP1-211ENST00000521591 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.05■■□□□ 1.44
TNIP1-211ENST00000521591 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TNIP1-211ENST00000521591 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.05■■□□□ 1.44
TNIP1-211ENST00000521591 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms