RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC5O15440 1437 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 ROCK1Q13464 1354 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 NEUROD1Q13562 356 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC2Q92887 1545 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-229ENST00000515802 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-229ENST00000515802 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-229ENST00000515802 ADGRL2O95490 1459 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-229ENST00000515802 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-229ENST00000515802 PREX2Q70Z35 1606 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 NCOA1Q15788 1441 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIM52Q96A61 297 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TONSLQ96HA7 1378 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 MIER1Q8N108 512 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 MBD5Q9P267 1494 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-229ENST00000515802 PZPP20742 1482 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 FOXD1Q16676 465 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 TSPY4P0CV99 314 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 TSPY10P0CW01 314 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 KCNH8Q96L42 1107 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF15Q9NS87 1388 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-229ENST00000515802 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 PLCH2O75038 1416 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 PLXNC1O60486 1568 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 BCL11AQ9H165 835 aa21.45■■□□□ 1.03
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC1P33527 1531 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NUP155O75694 1391 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 OSCARQ8IYS5 282 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PKD2Q13563 968 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 UNC13BO14795 1591 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-229ENST00000515802 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 ASXL2Q76L83 1435 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-229ENST00000515802 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 FANCAO15360 1455 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 ERBINQ96RT1 1412 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-229ENST00000515802 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.27■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 AFAP1Q8N556 730 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 ADGRL1O94910 1474 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.991e-7■■□□□ 13.6
SH3BP2-229ENST00000515802 ATP7AQ04656 1500 aa21.2■□□□□ 0.99
SH3BP2-229ENST00000515802 PLA2R1Q13018 1463 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-229ENST00000515802 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.2■□□□□ 0.98
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