RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492742.5

WDR4-207, Transcript of WD repeat domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene WDR4, Length 2,205 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4-207ENST00000492742 DAPK1P53355 1430 aa28.77■■■□□ 2.2
WDR4-207ENST00000492742 ROCK1Q13464 1354 aa28.76■■■□□ 2.19
WDR4-207ENST00000492742 ABCC5O15440 1437 aa28.73■■■□□ 2.19
WDR4-207ENST00000492742 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.73■■■□□ 2.19
WDR4-207ENST00000492742 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
WDR4-207ENST00000492742 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.72■■■□□ 2.19
WDR4-207ENST00000492742 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.7■■■□□ 2.19
WDR4-207ENST00000492742 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.7■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.7■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.7■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.69■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 KDM6BO15054 1643 aa28.65■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 TONSLQ96HA7 1378 aa28.64■■■□□ 2.18
WDR4-207ENST00000492742 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.64■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.62■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.6■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 ABCC2Q92887 1545 aa28.59■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.59■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
WDR4-207ENST00000492742 ADGRL2O95490 1459 aa28.56■■■□□ 2.16
WDR4-207ENST00000492742 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
WDR4-207ENST00000492742 KCNH8Q96L42 1107 aa28.53■■■□□ 2.16
WDR4-207ENST00000492742 NCOA1Q15788 1441 aa28.52■■■□□ 2.16
WDR4-207ENST00000492742 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.5■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 PREX2Q70Z35 1606 aa28.49■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.49■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 TRIM52Q96A61 297 aa28.47■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.47■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.46■■■□□ 2.15
WDR4-207ENST00000492742 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.45■■■□□ 2.14
WDR4-207ENST00000492742 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.42■■■□□ 2.14
WDR4-207ENST00000492742 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
WDR4-207ENST00000492742 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.131e-6■■□□□ 12.2
WDR4-207ENST00000492742 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.39■■■□□ 2.13
WDR4-207ENST00000492742 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.39■■■□□ 2.13
WDR4-207ENST00000492742 MBD5Q9P267 1494 aa28.38■■■□□ 2.13
WDR4-207ENST00000492742 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.36■■■□□ 2.13
WDR4-207ENST00000492742 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.34■■■□□ 2.13
WDR4-207ENST00000492742 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.31■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 PZPP20742 1482 aa28.31■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.31■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.31■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.3■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 TSPY4P0CV99 314 aa28.28■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 TSPY10P0CW01 314 aa28.28■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 FOXD1Q16676 465 aa28.28■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 CCER2I3L3R5 266 aa28.28■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.27■■■□□ 2.12
WDR4-207ENST00000492742 ANP32CO43423 234 aa28.26■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.114e-8■■■■■ 43.6
WDR4-207ENST00000492742 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.24■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.24■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.23■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.22■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.21■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
WDR4-207ENST00000492742 PLCH2O75038 1416 aa28.2■■■□□ 2.1
WDR4-207ENST00000492742 KIF15Q9NS87 1388 aa28.19■■■□□ 2.1
WDR4-207ENST00000492742 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.17■■■□□ 2.1
WDR4-207ENST00000492742 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.15■■■□□ 2.1
WDR4-207ENST00000492742 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.13■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 PLXNC1O60486 1568 aa28.13■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 30.4
WDR4-207ENST00000492742 OSCARQ8IYS5 282 aa28.1■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.1■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 NUP155O75694 1391 aa28.09■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.08■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.08■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 ABCC1P33527 1531 aa28.08■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.08■■■□□ 2.09
WDR4-207ENST00000492742 PKD2Q13563 968 aa28.06■■■□□ 2.08
WDR4-207ENST00000492742 UNC13BO14795 1591 aa28.02■■■□□ 2.08
WDR4-207ENST00000492742 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.02■■■□□ 2.08
WDR4-207ENST00000492742 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.99■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.98■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.97■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.97■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 CCDC7Q96M83 1385 aa27.96■■■□□ 2.07
WDR4-207ENST00000492742 ERBINQ96RT1 1412 aa27.94■■■□□ 2.06
WDR4-207ENST00000492742 ASXL2Q76L83 1435 aa27.93■■■□□ 2.06
WDR4-207ENST00000492742 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.93■■■□□ 2.06
WDR4-207ENST00000492742 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.91■■■□□ 2.06
WDR4-207ENST00000492742 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.91■■■□□ 2.06
WDR4-207ENST00000492742 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.91■■■□□ 2.06
WDR4-207ENST00000492742 FANCAO15360 1455 aa27.88■■■□□ 2.05
WDR4-207ENST00000492742 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.85■■■□□ 2.05
WDR4-207ENST00000492742 FKBP8Q14318 412 aa27.83■■■□□ 2.05
WDR4-207ENST00000492742 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.83■■■□□ 2.04
WDR4-207ENST00000492742 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.82■■■□□ 2.04
WDR4-207ENST00000492742 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms