RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492582.5

CHKB-212, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-212ENST00000492582 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CHKB-212ENST00000492582 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
CHKB-212ENST00000492582 TONSLQ96HA7 1378 aa41.48■■■■■ 4.23
CHKB-212ENST00000492582 ATP10BO94823 1461 aa41.47■■■■■ 4.23
CHKB-212ENST00000492582 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.47■■■■■ 4.23
CHKB-212ENST00000492582 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
CHKB-212ENST00000492582 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
CHKB-212ENST00000492582 TRIM52Q96A61 297 aa41.4■■■■■ 4.22
CHKB-212ENST00000492582 PTPRGP23470 1445 aa41.38■■■■■ 4.22
CHKB-212ENST00000492582 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.37■■■■■ 4.21
CHKB-212ENST00000492582 SHROOM2Q13796 1616 aa41.37■■■■■ 4.21
CHKB-212ENST00000492582 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CHKB-212ENST00000492582 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.34■■■■■ 4.21
CHKB-212ENST00000492582 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.31■■■■■ 4.2
CHKB-212ENST00000492582 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-212ENST00000492582 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-212ENST00000492582 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-212ENST00000492582 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.29■■■■■ 4.2
CHKB-212ENST00000492582 ADGRL2O95490 1459 aa41.24■■■■■ 4.19
CHKB-212ENST00000492582 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
CHKB-212ENST00000492582 NCOA1Q15788 1441 aa41.21■■■■■ 4.19
CHKB-212ENST00000492582 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CHKB-212ENST00000492582 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-212ENST00000492582 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-212ENST00000492582 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.08■■■■■ 4.17
CHKB-212ENST00000492582 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.07■■■■■ 4.17
CHKB-212ENST00000492582 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.06■■■■■ 4.16
CHKB-212ENST00000492582 FOXD1Q16676 465 aa41.05■■■■■ 4.16
CHKB-212ENST00000492582 PZPP20742 1482 aa41.03■■■■■ 4.16
CHKB-212ENST00000492582 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa41.03■■■■■ 4.16
CHKB-212ENST00000492582 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
CHKB-212ENST00000492582 ABCC2Q92887 1545 aa41.01■■■■■ 4.16
CHKB-212ENST00000492582 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 PREX2Q70Z35 1606 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.98■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.97■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.95■■■■■ 4.15
CHKB-212ENST00000492582 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-212ENST00000492582 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-212ENST00000492582 MBD5Q9P267 1494 aa40.9■■■■■ 4.14
CHKB-212ENST00000492582 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.89■■■■■ 4.14
CHKB-212ENST00000492582 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.87■■■■■ 4.13
CHKB-212ENST00000492582 OSCARQ8IYS5 282 aa40.86■■■■■ 4.13
CHKB-212ENST00000492582 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.86■■■■■ 4.13
CHKB-212ENST00000492582 TSPY4P0CV99 314 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-212ENST00000492582 TSPY10P0CW01 314 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-212ENST00000492582 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.134e-7■■■□□ 18.4
CHKB-212ENST00000492582 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
CHKB-212ENST00000492582 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.82■■■■■ 4.12
CHKB-212ENST00000492582 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-212ENST00000492582 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.78■■■■■ 4.12
CHKB-212ENST00000492582 KIF15Q9NS87 1388 aa40.74■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.74■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.74■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.73■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.72■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.7■■■■■ 4.11
CHKB-212ENST00000492582 PKD2Q13563 968 aa40.69■■■■■ 4.1
CHKB-212ENST00000492582 NUP155O75694 1391 aa40.66■■■■■ 4.1
CHKB-212ENST00000492582 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.66■■■■■ 4.1
CHKB-212ENST00000492582 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
CHKB-212ENST00000492582 KCNH8Q96L42 1107 aa40.65■■■■■ 4.1
CHKB-212ENST00000492582 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.64■■■■■ 4.1
CHKB-212ENST00000492582 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.61■■■■■ 4.09
CHKB-212ENST00000492582 ANP32CO43423 234 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-212ENST00000492582 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.54■■■■■ 4.08
CHKB-212ENST00000492582 CCER2I3L3R5 266 aa40.54■■■■■ 4.08
CHKB-212ENST00000492582 PLCH2O75038 1416 aa40.53■■■■■ 4.08
CHKB-212ENST00000492582 PLXNC1O60486 1568 aa40.49■■■■■ 4.07
CHKB-212ENST00000492582 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.47■■■■■ 4.07
CHKB-212ENST00000492582 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.45■■■■■ 4.07
CHKB-212ENST00000492582 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.44■■■■■ 4.06
CHKB-212ENST00000492582 UNC13BO14795 1591 aa40.43■■■■■ 4.06
CHKB-212ENST00000492582 ABCC1P33527 1531 aa40.39■■■■■ 4.06
CHKB-212ENST00000492582 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.38■■■■■ 4.06
CHKB-212ENST00000492582 CCDC7Q96M83 1385 aa40.35■■■■■ 4.05
CHKB-212ENST00000492582 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.33■■■■■ 4.05
CHKB-212ENST00000492582 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.33■■■■■ 4.05
CHKB-212ENST00000492582 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.33■■■■■ 4.05
CHKB-212ENST00000492582 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CHKB-212ENST00000492582 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.32■■■■■ 4.05
CHKB-212ENST00000492582 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
CHKB-212ENST00000492582 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKB-212ENST00000492582 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.27■■■■■ 4.04
CHKB-212ENST00000492582 ERBINQ96RT1 1412 aa40.25■■■■■ 4.03
CHKB-212ENST00000492582 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
CHKB-212ENST00000492582 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.22■■■■■ 4.03
CHKB-212ENST00000492582 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.22■■■■■ 4.03
CHKB-212ENST00000492582 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CHKB-212ENST00000492582 KDM5CP41229 1560 aa40.19■■■■■ 4.02
CHKB-212ENST00000492582 USP47Q96K76 1375 aa40.18■■■■■ 4.02
CHKB-212ENST00000492582 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.18■■■■■ 4.02
CHKB-212ENST00000492582 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.15■■■■■ 4.02
CHKB-212ENST00000492582 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.029e-8■■■□□ 18
CHKB-212ENST00000492582 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.13■■■■■ 4.01
CHKB-212ENST00000492582 PLA2R1Q13018 1463 aa40.12■■■■■ 4.01
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