RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PRAME-210ENST00000442481 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.28■□□□□ 0.68
PRAME-210ENST00000442481 FMN1Q68DA7 1419 aa19.26■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 PLCH2O75038 1416 aa19.25■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.25■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 CERKQ8TCT0 537 aa19.24■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.23■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.22■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.21■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 ATP10AO60312 1499 aa19.21■□□□□ 0.67
PRAME-210ENST00000442481 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.2■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 KIF14Q15058 1648 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 CLIP1P30622 1438 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PRAME-210ENST00000442481 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 STRCQ7RTU9 1775 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.12■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 KDM5CP41229 1560 aa19.11■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.11■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.1■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 AFAP1Q8N556 730 aa19.1■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.08■□□□□ 0.65
PRAME-210ENST00000442481 REREQ9P2R6 1566 aa19.07■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.07■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.06■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 ABCA6Q8N139 1617 aa19.05■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 ILDR2Q71H61 639 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 C3P01024 1663 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-210ENST00000442481 PREX2Q70Z35 1606 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 DISP3Q9P2K9 1392 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 AGLP35573 1532 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 ABCC1P33527 1531 aa18.99■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 PTPRTO14522 1441 aa18.99■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.98■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.96■□□□□ 0.63
PRAME-210ENST00000442481 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.94■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 NCOA1Q15788 1441 aa18.92■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 SOCS7O14512 581 aa18.91■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.9■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.9■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.9■□□□□ 0.62
PRAME-210ENST00000442481 MROH2AA6NES4 1674 aa18.87■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 NPATQ14207 1427 aa18.87■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.87■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.87■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.86■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.86■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.84■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZMYM3Q14202 1370 aa18.83■□□□□ 0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.82■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.81■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.63e-11■□□□□ 9.5
PRAME-210ENST00000442481 ATP7AQ04656 1500 aa18.79■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 PLXNC1O60486 1568 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.77■□□□□ 0.6
PRAME-210ENST00000442481 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 A2MP01023 1474 aa18.76■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 PTPRKQ15262 1439 aa18.75■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 PKD2Q13563 968 aa18.75■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 PLA2R1Q13018 1463 aa18.75■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.74■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.73■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.71■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 GGT6Q6P531 493 aa18.71■□□□□ 0.59
PRAME-210ENST00000442481 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.67■□□□□ 0.58
PRAME-210ENST00000442481 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.66■□□□□ 0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PRAME-210ENST00000442481 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.64■□□□□ 0.58
PRAME-210ENST00000442481 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.64■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 MBD5Q9P267 1494 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 TIAM1Q13009 1591 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 CEP162Q5TB80 1403 aa18.61■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 374.5 ms