RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439806.6

CPNE1-218, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 5

Gene CPNE1, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-218ENST00000439806 TRIM52Q96A61 297 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 ROCK1Q13464 1354 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
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CPNE1-218ENST00000439806 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.92□□□□□ -0.02
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CPNE1-218ENST00000439806 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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CPNE1-218ENST00000439806 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.78□□□□□ -0.04
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CPNE1-218ENST00000439806 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 9.4
CPNE1-218ENST00000439806 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CPNE1-218ENST00000439806 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.44□□□□□ -0.1
CPNE1-218ENST00000439806 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.44□□□□□ -0.1
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