RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428825.8

AC060234.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC060234.2, Length 1,610 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC060234.2-201ENST00000428825 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.8■■□□□ 1.08
AC060234.2-201ENST00000428825 NEUROD1Q13562 356 aa21.79■■□□□ 1.08
AC060234.2-201ENST00000428825 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.78■■□□□ 1.08
AC060234.2-201ENST00000428825 PTPRGP23470 1445 aa21.76■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 MIER1Q8N108 512 aa21.76■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.73■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.72■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 ADGRL2O95490 1459 aa21.71■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.71■■□□□ 1.07
AC060234.2-201ENST00000428825 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.69■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 TONSLQ96HA7 1378 aa21.67■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 PREX2Q70Z35 1606 aa21.66■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.66■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCC2Q92887 1545 aa21.65■■□□□ 1.06
AC060234.2-201ENST00000428825 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.64■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 NCOA1Q15788 1441 aa21.63■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 TRIM52Q96A61 297 aa21.62■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.62■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.61■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.59■■□□□ 1.05
AC060234.2-201ENST00000428825 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 PZPP20742 1482 aa21.57■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.56■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.55■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.54■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.53■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.53■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.53■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 MBD5Q9P267 1494 aa21.52■■□□□ 1.04
AC060234.2-201ENST00000428825 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.48■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.47■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.47■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.47■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.47■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 FOXD1Q16676 465 aa21.46■■□□□ 1.03
AC060234.2-201ENST00000428825 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AC060234.2-201ENST00000428825 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.44■■□□□ 1.02
AC060234.2-201ENST00000428825 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AC060234.2-201ENST00000428825 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.43■■□□□ 1.02
AC060234.2-201ENST00000428825 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.42■■□□□ 1.02
AC060234.2-201ENST00000428825 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
AC060234.2-201ENST00000428825 PLXNC1O60486 1568 aa21.39■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.38■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 KIF15Q9NS87 1388 aa21.38■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 TSPY4P0CV99 314 aa21.38■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 TSPY10P0CW01 314 aa21.38■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.38■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.37■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 UNC13BO14795 1591 aa21.34■■□□□ 1.01
AC060234.2-201ENST00000428825 PLCH2O75038 1416 aa21.33■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCC1P33527 1531 aa21.31■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.31■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.31■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 PKD2Q13563 968 aa21.3■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 NUP155O75694 1391 aa21.3■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.28■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.27■■□□□ 1
AC060234.2-201ENST00000428825 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.26■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 KCNH8Q96L42 1107 aa21.26■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.25■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.24■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.23■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.23■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.21■□□□□ 0.99
AC060234.2-201ENST00000428825 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.2■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.2■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.19■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.18■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 ERBINQ96RT1 1412 aa21.17■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.17■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 CCER2I3L3R5 266 aa21.15■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.15■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 ANP32CO43423 234 aa21.15■□□□□ 0.98
AC060234.2-201ENST00000428825 KDM5CP41229 1560 aa21.14■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.13■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.12■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 CCDC7Q96M83 1385 aa21.11■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.11■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.1■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 ASXL2Q76L83 1435 aa21.1■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 DEPDC5O75140 1603 aa21.09■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 PLA2R1Q13018 1463 aa21.09■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 FANCAO15360 1455 aa21.08■□□□□ 0.97
AC060234.2-201ENST00000428825 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms