RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP10BO94823 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHROOM2Q13796 1616 aa26.82■■□□□ 1.88
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.8■■□□□ 1.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.8■■□□□ 1.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.79■■□□□ 1.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.79■■□□□ 1.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.77■■□□□ 1.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRL2O95490 1459 aa26.73■■□□□ 1.87
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCOA1Q15788 1441 aa26.72■■□□□ 1.87
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.64■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.63■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD1Q16676 465 aa26.62■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.62■■□□□ 1.85
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PZPP20742 1482 aa26.6■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PREX2Q70Z35 1606 aa26.59■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.58■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC2Q92887 1545 aa26.58■■□□□ 1.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.57■■□□□ 1.84
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.57■■□□□ 1.84
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.54■■□□□ 1.84
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.53■■□□□ 1.84
NUP50-AS1-201ENST00000426282 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.52■■□□□ 1.84
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.51■■□□□ 1.84
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBD5Q9P267 1494 aa26.51■■□□□ 1.84
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.5■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPY4P0CV99 314 aa26.47■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPY10P0CW01 314 aa26.47■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.46■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.46■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.42■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF15Q9NS87 1388 aa26.42■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.42■■□□□ 1.82
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.41■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNH8Q96L42 1107 aa26.4■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKD2Q13563 968 aa26.38■■□□□ 1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.38■■□□□ 1.81
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUP155O75694 1391 aa26.37■■□□□ 1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.35■■□□□ 1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.35■■□□□ 1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANP32CO43423 234 aa26.34■■□□□ 1.81
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.31■■□□□ 1.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.3■■□□□ 1.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCER2I3L3R5 266 aa26.29■■□□□ 1.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLXNC1O60486 1568 aa26.26■■□□□ 1.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCH2O75038 1416 aa26.26■■□□□ 1.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.24■■□□□ 1.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.23■■□□□ 1.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.23■■□□□ 1.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC13BO14795 1591 aa26.22■■□□□ 1.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC1P33527 1531 aa26.18■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC7Q96M83 1385 aa26.17■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.16■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.16■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.15■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.15■■□□□ 1.78
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.14■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.12■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.11■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERBINQ96RT1 1412 aa26.1■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.09■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.08■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM5CP41229 1560 aa26.08■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.08■■□□□ 1.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP47Q96K76 1375 aa26.07■■□□□ 1.76
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.06■■□□□ 1.76
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.03■■□□□ 1.76
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.03■■□□□ 1.76
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.02■■□□□ 1.76
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2R1Q13018 1463 aa26.02■■□□□ 1.76
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