RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 MAPKBP1O60336 1514 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-201ENST00000402521 CCER2I3L3R5 266 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 PTPRKQ15262 1439 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 ASXL2Q76L83 1435 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-201ENST00000402521 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 FOXD1Q16676 465 aa13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIM52Q96A61 297 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 SETD5Q9C0A6 1442 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 MIA2Q96PC5 1412 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-201ENST00000402521 NEFLP07196 543 aa12.96□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 FKBP8Q14318 412 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCC5O15440 1437 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 PREX2Q70Z35 1606 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 PLCH2O75038 1416 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 DAPK1P53355 1430 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-201ENST00000402521 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCA9Q8IUA7 1624 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 MBD5Q9P267 1494 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 AFAP1Q8N556 730 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 NAIPQ13075 1403 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 CD109Q6YHK3 1445 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 KDM6BO15054 1643 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 FANCAO15360 1455 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 ANP32CO43423 234 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 HFM1A2PYH4 1435 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-201ENST00000402521 AKNAQ7Z591 1439 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 TSPY4P0CV99 314 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 TSPY10P0CW01 314 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 NCOA1Q15788 1441 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 MSH5O43196 834 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCC1P33527 1531 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.366e-7■■■□□ 16
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 DIP2BQ9P265 1576 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 TSPOAP1O95153 1857 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 RAPGEF3O95398 923 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 ADGRL1O94910 1474 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 ROCK1Q13464 1354 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 ARAP3Q8WWN8 1544 aa12.77□□□□□ -0.36
EFTUD2-201ENST00000402521 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 BCANQ96GW7 911 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 KIF15Q9NS87 1388 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 ADGRL2O95490 1459 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 GLI2P10070 1586 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-201ENST00000402521 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.8 ms