RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 PREX2Q70Z35 1606 aa26.87■■□□□ 1.89
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TM2D2-201ENST00000397070 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.82■■□□□ 1.88
TM2D2-201ENST00000397070 ABCC5O15440 1437 aa26.8■■□□□ 1.88
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TM2D2-201ENST00000397070 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.47■■□□□ 1.83
TM2D2-201ENST00000397070 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.46■■□□□ 1.83
TM2D2-201ENST00000397070 ABCC1P33527 1531 aa26.44■■□□□ 1.82
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TM2D2-201ENST00000397070 NEUROD1Q13562 356 aa26.41■■□□□ 1.82
TM2D2-201ENST00000397070 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.41■■□□□ 1.82
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TM2D2-201ENST00000397070 TSPY10P0CW01 314 aa26.4■■□□□ 1.82
TM2D2-201ENST00000397070 PZPP20742 1482 aa26.4■■□□□ 1.82
TM2D2-201ENST00000397070 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.39■■□□□ 1.81
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TM2D2-201ENST00000397070 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.32■■□□□ 1.8
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TM2D2-201ENST00000397070 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.29■■□□□ 1.8
TM2D2-201ENST00000397070 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.29■■□□□ 1.8
TM2D2-201ENST00000397070 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.27■■□□□ 1.8
TM2D2-201ENST00000397070 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
TM2D2-201ENST00000397070 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TM2D2-201ENST00000397070 FANCAO15360 1455 aa26.23■■□□□ 1.79
TM2D2-201ENST00000397070 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TM2D2-201ENST00000397070 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.22■■□□□ 1.79
TM2D2-201ENST00000397070 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.21■■□□□ 1.79
TM2D2-201ENST00000397070 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
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TM2D2-201ENST00000397070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.19■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.19■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.19■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 ERBINQ96RT1 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.18■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.17■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.17■■□□□ 1.78
TM2D2-201ENST00000397070 NUP155O75694 1391 aa26.16■■□□□ 1.78
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TM2D2-201ENST00000397070 GLI2P10070 1586 aa26.01■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.01■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 NEO1Q92859 1461 aa25.97■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 TET3O43151 1660 aa25.97■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.97■■□□□ 1.75
TM2D2-201ENST00000397070 E9PCH4 1651 aa25.95■■□□□ 1.74
TM2D2-201ENST00000397070 AFAP1Q8N556 730 aa25.95■■□□□ 1.74
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