RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384710.1

RNU6-21P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 21, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-21P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-21P-201ENST00000384710 POTEB3A0JP26 581 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-21P-201ENST00000384710 EMP3P54852 163 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-21P-201ENST00000384710 POTEBQ6S5H4 581 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-21P-201ENST00000384710 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 RIMBP2O15034 1052 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 PPP1R37O75864 691 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 GPR153Q6NV75 609 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 C2orf72A6NCS6 295 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 FAM205CA6NFA0 338 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 SLC34A2O95436 690 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-21P-201ENST00000384710 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 ERBB3P21860 1342 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 FOXK1P85037 733 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 ARSIQ5FYB1 569 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 TMC2Q8TDI7 906 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 MMRN1Q13201 1228 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 DSG2Q14126 1118 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 NUDT7P0C024 238 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 PLPP6Q8IY26 295 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-21P-201ENST00000384710 LHX6Q9UPM6 363 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 PBX2P40425 430 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 OXER1Q8TDS5 423 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 MFSD10Q14728 455 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 PTGER2P43116 358 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 PDE4AP27815 886 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-21P-201ENST00000384710 TBC1D12O60347 775 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 ARHGAP33O14559 1287 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 TK2O00142 265 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-21P-201ENST00000384710 FOSBP53539 338 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 CAMK2BQ13554 666 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 HRO43593 1189 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 EVI5O60447 810 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 JPH4Q96JJ6 628 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 PSEN2P49810 448 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-21P-201ENST00000384710 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 KCNK17Q96T54 332 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 MAP3K9P80192 1104 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 PTPREP23469 700 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 PHF14O94880 888 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 KCNH8Q96L42 1107 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 DPYSL4O14531 572 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 PDIA6Q15084 440 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 FBXW7Q969H0 707 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-21P-201ENST00000384710 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-21P-201ENST00000384710 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-21P-201ENST00000384710 EPAS1Q99814 870 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-21P-201ENST00000384710 HCSTQ9UBK5 93 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-21P-201ENST00000384710 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-21P-201ENST00000384710 COL9A1P20849 921 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-21P-201ENST00000384710 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms