RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HRO43593 1189 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTECB2RU33 542 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEEQ6S8J3 1075 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFNL1Q8IU54 200 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCTD17Q8N5Z5 321 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STAC3Q96MF2 364 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AXIN2Q9Y2T1 843 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TK2O00142 265 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCE1DQ5T752 114 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 G3V3G9 751 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCAF8Q5TAQ9 597 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP33O14559 1287 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATXN8OSP0DMR3 200 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARSIQ5FYB1 569 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BOLA1Q9Y3E2 137 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYT1Q01538 1121 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RASEFQ8IZ41 740 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRKD2Q9BZL6 878 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNMA1Q12791 1236 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 V9GY48 417 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA2Q08379 1002 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EHMT2Q96KQ7 1210 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXD4L1Q9NU39 408 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKDCCQ504Y2 493 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNC4Q03721 635 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DGAT1O75907 488 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHA1P01876 353 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCE2CQ5TA81 110 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GSK3AP49840 483 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DMRTA1Q5VZB9 504 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q8N3U1 123 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GDF11O95390 407 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WNT2BQ93097 391 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAM23O75077 832 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LHX6Q9UPM6 363 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSEN2P49810 448 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LAMC2Q13753 1193 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUDT7P0C024 238 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RASSF7Q02833 373 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NYAP1Q6ZVC0 841 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AAASQ9NRG9 546 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ST8SIA5O15466 376 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COBLO75128 1261 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXK2Q01167 660 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM92Q6UXU6 159 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNH8Q96L42 1107 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLEKHG5O94827 1062 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GMPRP36959 345 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM67Q6ZTA4 783 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC16A10Q8TF71 515 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM187AA6NFU0 413 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHB8Q9UN66 801 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNA4P22459 653 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR20EP86478 221 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR20CP86479 221 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR20DP86480 221 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR20BP86481 221 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR20AP86496 221 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R18Q6NYC8 613 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRIPAKQ8N1N5 446 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC4A5Q9BY07 1137 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRF7Q92985 503 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM212AQ96EL1 285 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNK17Q96T54 332 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKK1Q8NFD2 765 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DACH1Q9UI36 760 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NBPF3Q9H094 633 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms