RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.03■■□□□ 1.92
SNX11-201ENST00000359238 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SNX11-201ENST00000359238 KDM6BO15054 1643 aa27.01■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX11-201ENST00000359238 ABCC5O15440 1437 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 DAPK1P53355 1430 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 KCNH8Q96L42 1107 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 MIER1Q8N108 512 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.91■■□□□ 1.9
SNX11-201ENST00000359238 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.87■■□□□ 1.89
SNX11-201ENST00000359238 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
SNX11-201ENST00000359238 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX11-201ENST00000359238 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SNX11-201ENST00000359238 AKNAQ7Z591 1439 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX11-201ENST00000359238 PREX2Q70Z35 1606 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX11-201ENST00000359238 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX11-201ENST00000359238 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 ROCK1Q13464 1354 aa26.73■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 ASXL2Q76L83 1435 aa26.73■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 TRIM52Q96A61 297 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 NCOA1Q15788 1441 aa26.7■■□□□ 1.87
SNX11-201ENST00000359238 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.68■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 FOXD1Q16676 465 aa26.68■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 MBD5Q9P267 1494 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 PLCH2O75038 1416 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.64■■□□□ 1.86
SNX11-201ENST00000359238 ADGRL2O95490 1459 aa26.63■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.63■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.61■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 TSPY4P0CV99 314 aa26.6■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 TSPY10P0CW01 314 aa26.6■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.6■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.59■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.59■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.59■■□□□ 1.85
SNX11-201ENST00000359238 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.59■■□□□ 1.85
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SNX11-201ENST00000359238 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.56■■□□□ 1.84
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SNX11-201ENST00000359238 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX11-201ENST00000359238 PZPP20742 1482 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX11-201ENST00000359238 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 ABCC1P33527 1531 aa26.5■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 FANCAO15360 1455 aa26.49■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 KIF15Q9NS87 1388 aa26.49■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.49■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.47■■□□□ 1.83
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SNX11-201ENST00000359238 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 TONSLQ96HA7 1378 aa26.46■■□□□ 1.83
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 AFAP1Q8N556 730 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 CD109Q6YHK3 1445 aa26.41■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.4■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.4■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 BCL11AQ9H165 835 aa26.39■■□□□ 1.82
SNX11-201ENST00000359238 ADGRL1O94910 1474 aa26.38■■□□□ 1.81
SNX11-201ENST00000359238 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.36■■□□□ 1.81
SNX11-201ENST00000359238 NUP155O75694 1391 aa26.34■■□□□ 1.81
SNX11-201ENST00000359238 PKD2Q13563 968 aa26.33■■□□□ 1.81
SNX11-201ENST00000359238 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SNX11-201ENST00000359238 PLXNC1O60486 1568 aa26.32■■□□□ 1.8
SNX11-201ENST00000359238 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.3■■□□□ 1.8
SNX11-201ENST00000359238 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
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SNX11-201ENST00000359238 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.26■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.26■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.25■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.24■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.23■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.23■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 ATP7AQ04656 1500 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX11-201ENST00000359238 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.2■■□□□ 1.78
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