RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-204ENST00000352260 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 AKNAQ7Z591 1439 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 DAPK1P53355 1430 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.95■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC5O15440 1437 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC2Q92887 1545 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 ROCK1Q13464 1354 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-204ENST00000352260 KDM6BO15054 1643 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-204ENST00000352260 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 MIER1Q8N108 512 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 PREX2Q70Z35 1606 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRL2O95490 1459 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.873e-6■■□□□ 13.1
SPNS1-204ENST00000352260 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM52Q96A61 297 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 NCOA1Q15788 1441 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 MBD5Q9P267 1494 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 KCNH8Q96L42 1107 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 TONSLQ96HA7 1378 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY4P0CV99 314 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY10P0CW01 314 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 PLCH2O75038 1416 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 PZPP20742 1482 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 ASXL2Q76L83 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 KIF15Q9NS87 1388 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 FOXD1Q16676 465 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.45■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC1P33527 1531 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.39■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 DIP2BQ9P265 1576 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 PLXNC1O60486 1568 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 NUP155O75694 1391 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 PKD2Q13563 968 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 GLI2P10070 1586 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 FANCAO15360 1455 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 UNC13BO14795 1591 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 ERBINQ96RT1 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 AFAP1Q8N556 730 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRL1O94910 1474 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.14■■□□□ 1.77
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