RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC5O15440 1437 aa27.64■■■□□ 2.01
SPNS1-201ENST00000311008 NUP160Q12769 1436 aa27.64■■■□□ 2.01
SPNS1-201ENST00000311008 ANP32CO43423 234 aa27.61■■■□□ 2.01
SPNS1-201ENST00000311008 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SPNS1-201ENST00000311008 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.58■■■□□ 2.01
SPNS1-201ENST00000311008 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.57■■■□□ 2
SPNS1-201ENST00000311008 KCNH8Q96L42 1107 aa27.56■■■□□ 2
SPNS1-201ENST00000311008 JPH4Q96JJ6 628 aa27.55■■■□□ 2
SPNS1-201ENST00000311008 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.55■■■□□ 2
SPNS1-201ENST00000311008 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
SPNS1-201ENST00000311008 FBLN2P98095 1184 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.45■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRL2O95490 1459 aa27.45■■□□□ 1.99
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA8O94911 1581 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 NCOA1Q15788 1441 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 KIF14Q15058 1648 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.39■■□□□ 1.98
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.37■■□□□ 1.97
SPNS1-201ENST00000311008 FOXD1Q16676 465 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-201ENST00000311008 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-201ENST00000311008 PZPP20742 1482 aa27.34■■□□□ 1.97
SPNS1-201ENST00000311008 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS1-201ENST00000311008 ATP10BO94823 1461 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-201ENST00000311008 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SPNS1-201ENST00000311008 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.28■■□□□ 1.96
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.28■■□□□ 1.96
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-201ENST00000311008 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRGP23470 1445 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC7Q96M83 1385 aa27.21■■□□□ 1.95
SPNS1-201ENST00000311008 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.21■■□□□ 1.95
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.19■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 TSPY4P0CV99 314 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 TSPY10P0CW01 314 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 MBD5Q9P267 1494 aa27.16■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 PKD2Q13563 968 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 NEFLP07196 543 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-201ENST00000311008 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
SPNS1-201ENST00000311008 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-201ENST00000311008 NUP155O75694 1391 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-201ENST00000311008 FKBP8Q14318 412 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-201ENST00000311008 SHROOM2Q13796 1616 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 PREX2Q70Z35 1606 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 KIF15Q9NS87 1388 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 CHD1O14646 1710 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-201ENST00000311008 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-201ENST00000311008 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-201ENST00000311008 USP47Q96K76 1375 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS1-201ENST00000311008 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-201ENST00000311008 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC2Q92887 1545 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 KDM5CP41229 1560 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 BCANQ96GW7 911 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.93e-6■■□□□ 13.1
SPNS1-201ENST00000311008 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-201ENST00000311008 MRS2Q9HD23 443 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC184Q52MB2 194 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 UNC13BO14795 1591 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 PLXNC1O60486 1568 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SPNS1-201ENST00000311008 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-201ENST00000311008 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-201ENST00000311008 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.78■■□□□ 1.88
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