RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281456.10

SLC25A4-201, Transcript of solute carrier family 25 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A4, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4-201ENST00000281456 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 GRIN2AQ12879 1464 aa21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 KANK1Q14678 1352 aa21.33■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 IQGAP2Q13576 1575 aa21.33■■□□□ 1
SLC25A4-201ENST00000281456 TIAM1Q13009 1591 aa21.33■■□□□ 1
SLC25A4-201ENST00000281456 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SLC25A4-201ENST00000281456 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SLC25A4-201ENST00000281456 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SLC25A4-201ENST00000281456 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.23■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
SLC25A4-201ENST00000281456 AFAP1Q8N556 730 aa21.18■□□□□ 0.98
SLC25A4-201ENST00000281456 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.18■□□□□ 0.98
SLC25A4-201ENST00000281456 HECW1Q76N89 1606 aa21.17■□□□□ 0.98
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF15Q9NS87 1388 aa21.17■□□□□ 0.98
SLC25A4-201ENST00000281456 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.16■□□□□ 0.98
SLC25A4-201ENST00000281456 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.14■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 UACAQ9BZF9 1416 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 NEFMP07197 916 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 CDCA8Q53HL2 280 aa21.12■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 MIA2Q96PC5 1412 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 FKBP8Q14318 412 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.09■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
SLC25A4-201ENST00000281456 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.07■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 TMF1P82094 1093 aa21.06■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 MAP3K1Q13233 1512 aa21.06■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 POGKQ9P215 609 aa21.06■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.05■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 HFM1A2PYH4 1435 aa21.03■□□□□ 0.96
SLC25A4-201ENST00000281456 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 WDR62O43379 1518 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 SLC24A1O60721 1099 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 STK26Q9P289 416 aa21■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 ARHGEF11O15085 1522 aa20.99■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 ADAMTS12P58397 1594 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 DAPK1P53355 1430 aa20.97■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 NAIPQ13075 1403 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC25A4-201ENST00000281456 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 C14orf37Q86TY3 774 aa20.92■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 PLEKHG5O94827 1062 aa20.91■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.91■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.9■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
SLC25A4-201ENST00000281456 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.89■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 RAPGEF3O95398 923 aa20.88■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 CCER2I3L3R5 266 aa20.88■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCC5O15440 1437 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 ATP10BO94823 1461 aa20.84■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.84■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.83■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 USP47Q96K76 1375 aa20.83■□□□□ 0.93
SLC25A4-201ENST00000281456 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 ROCK1Q13464 1354 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 BCL11AQ9H165 835 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 CFAP53Q96M91 514 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 NUP160Q12769 1436 aa20.8■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.79■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 KIAA0556O60303 1618 aa20.79■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 NEUROD2Q15784 382 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 PTPRKQ15262 1439 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 PBRM1Q86U86 1689 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 DISP1Q96F81 1524 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.77■□□□□ 0.92
SLC25A4-201ENST00000281456 NCOA1Q15788 1441 aa20.77■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.77■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF14Q15058 1648 aa20.77■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 AKNAQ7Z591 1439 aa20.73■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 MORC1Q86VD1 984 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 572.3 ms