RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.3□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 AKNAQ7Z591 1439 aa14.29□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 NAIPQ13075 1403 aa14.29□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.27□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.27□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 MIA2Q96PC5 1412 aa14.27□□□□□ -0.13
PDCL-201ENST00000259467 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PDCL-201ENST00000259467 KIF14Q15058 1648 aa14.26□□□□□ -0.13
PDCL-201ENST00000259467 ASXL2Q76L83 1435 aa14.24□□□□□ -0.13
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PDCL-201ENST00000259467 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PDCL-201ENST00000259467 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.2□□□□□ -0.14
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PDCL-201ENST00000259467 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
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PDCL-201ENST00000259467 NCOA1Q15788 1441 aa13.97□□□□□ -0.17
PDCL-201ENST00000259467 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.97□□□□□ -0.17
PDCL-201ENST00000259467 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.96□□□□□ -0.17
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PDCL-201ENST00000259467 PZPP20742 1482 aa13.96□□□□□ -0.17
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PDCL-201ENST00000259467 MBD5Q9P267 1494 aa13.94□□□□□ -0.18
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PDCL-201ENST00000259467 ADGRL1O94910 1474 aa13.93□□□□□ -0.18
PDCL-201ENST00000259467 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.93□□□□□ -0.18
PDCL-201ENST00000259467 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.92□□□□□ -0.18
PDCL-201ENST00000259467 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
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PDCL-201ENST00000259467 ABCC1P33527 1531 aa13.9□□□□□ -0.18
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PDCL-201ENST00000259467 TSPY10P0CW01 314 aa13.9□□□□□ -0.18
PDCL-201ENST00000259467 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
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PDCL-201ENST00000259467 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.88□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.87□□□□□ -0.19
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PDCL-201ENST00000259467 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.86□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.86□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.85□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.85□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 ANP32CO43423 234 aa13.84□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.84□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.19
PDCL-201ENST00000259467 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.83□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 NEO1Q92859 1461 aa13.83□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.82□□□□□ -0.2
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