RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NexmifQ5DTT1 1515 aa47.24■■■■■ 5.15
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 A2mQ6GQT1 1474 aa47.06■■■■■ 5.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfyve16Q80U44 1528 aa47.02■■■■■ 5.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccnb3Q810T2 1396 aa47.01■■■■■ 5.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Depdc5P61460 1591 aa47.01■■■■■ 5.12
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adcy10Q8C0T9 1614 aa46.78■■■■■ 5.08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Caskin1Q6P9K8 1431 aa46.78■■■■■ 5.08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tdrd9Q14BI7 1383 aa46.72■■■■■ 5.07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa46.71■■■■■ 5.07
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm5cP41230 1554 aa46.16■■■■■ 4.98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hecw2Q6I6G8 1578 aa46.16■■■■■ 4.98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hecw1Q8K4P8 1604 aa46.15■■■■■ 4.98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cabp1Q9JLK7 227 aa46.13■■■■■ 4.97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il16O54824 1322 aa46.12■■■■■ 4.97
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp10aO54827 1508 aa46.08■■■■■ 4.97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chic2Q9D9G3 165 aa46.05■■■■■ 4.96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Neurl4Q5NCX5 1563 aa46.04■■■■■ 4.96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Naip2Q9QUK4 1447 aa46.04■■■■■ 4.96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ptch1Q61115 1434 aa46.03■■■■■ 4.96
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fmn2Q9JL04 1578 aa45.94■■■■■ 4.95
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa45.89■■■■■ 4.94
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plppr3Q7TPB0 716 aa45.87■■■■■ 4.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa45.87■■■■■ 4.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nos1Q9Z0J4 1429 aa45.86■■■■■ 4.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rfx7F8VPJ6 1459 aa45.83■■■■■ 4.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa45.82■■■■■ 4.93
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fhad1A6PWD2 1420 aa45.64■■■■■ 4.9
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa45.6■■■■■ 4.89
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Camsap2Q8C1B1 1461 aa45.39■■■■■ 4.86
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uggt2E9Q4X2 1504 aa45.36■■■■■ 4.85
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