RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049575.7

Cltb-201, Transcript of Clathrin light chain B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cltb, Length 1,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rnf17Q99MV7 1640 aa27.03■■□□□ 1.92
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa26.98■■□□□ 1.91
Cltb-201ENSMUST00000049575 Abca9Q8K449 1623 aa26.98■■□□□ 1.91
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mug1P28665 1476 aa26.97■■□□□ 1.91
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa26.97■■□□□ 1.91
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa26.92■■□□□ 1.9
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fam163aQ8CAA5 168 aa26.92■■□□□ 1.9
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Cltb-201ENSMUST00000049575 Hecw2Q6I6G8 1578 aa26.85■■□□□ 1.89
Cltb-201ENSMUST00000049575 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa26.82■■□□□ 1.88
Cltb-201ENSMUST00000049575 Lmod2Q3UHZ5 550 aa26.82■■□□□ 1.88
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa26.82■■□□□ 1.88
Cltb-201ENSMUST00000049575 Qser1A2BIE1 1698 aa26.82■■□□□ 1.88
Cltb-201ENSMUST00000049575 CntlnA2AM05 1397 aa26.8■■□□□ 1.88
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kiaa0556Q8C753 1610 aa26.79■■□□□ 1.88
Cltb-201ENSMUST00000049575 Arhgap5P97393 1501 aa26.76■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 NexmifQ5DTT1 1515 aa26.76■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Synj2Q9D2G5 1434 aa26.74■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Naip2Q9QUK4 1447 aa26.73■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cul9Q80TT8 1865 aa26.72■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Peg3Q3URU2 1571 aa26.71■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kidins220E9Q9B7 1793 aa26.71■■□□□ 1.87
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tiam1Q60610 1591 aa26.67■■□□□ 1.86
Cltb-201ENSMUST00000049575 Naip1Q9QWK5 1403 aa26.66■■□□□ 1.86
Cltb-201ENSMUST00000049575 Brwd3A2AHJ4 1799 aa26.66■■□□□ 1.86
Cltb-201ENSMUST00000049575 OvosQ3UU35 1456 aa26.63■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Yeats2Q3TUF7 1407 aa26.63■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa26.62■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ptch1Q61115 1434 aa26.62■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Trappc8E9PWG2 1437 aa26.61■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa26.61■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dip2cE9PWR4 1557 aa26.58■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Lemd3Q9WU40 921 aa26.58■■□□□ 1.85
Cltb-201ENSMUST00000049575 Adcy10Q8C0T9 1614 aa26.57■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kdm5cP41230 1554 aa26.56■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tdrd9Q14BI7 1383 aa26.56■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa26.54■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 RereQ80TZ9 1558 aa26.54■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 Abcc3B2RX12 1523 aa26.53■■□□□ 1.84
Cltb-201ENSMUST00000049575 Atp10aO54827 1508 aa26.5■■□□□ 1.83
Cltb-201ENSMUST00000049575 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa26.49■■□□□ 1.83
Cltb-201ENSMUST00000049575 NpatQ8BMA5 1420 aa26.48■■□□□ 1.83
Cltb-201ENSMUST00000049575 Neurl4Q5NCX5 1563 aa26.48■■□□□ 1.83
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cfap74Q3UY96 1578 aa26.47■■□□□ 1.83
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cyb5rlB1AS42 316 aa26.46■■□□□ 1.83
Cltb-201ENSMUST00000049575 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa26.45■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ccnb3Q810T2 1396 aa26.44■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa26.43■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cfap65Q3V0B4 1847 aa26.42■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Caskin1Q6P9K8 1431 aa26.42■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Camsap2Q8C1B1 1461 aa26.42■■□□□ 1.82
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Cltb-201ENSMUST00000049575 PtprmP28828 1452 aa26.36■■□□□ 1.81
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa26.35■■□□□ 1.81
Cltb-201ENSMUST00000049575 Hecw1Q8K4P8 1604 aa26.33■■□□□ 1.81
Cltb-201ENSMUST00000049575 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Cltb-201ENSMUST00000049575 MyclP10166 368 aa26.3■■□□□ 1.8
Cltb-201ENSMUST00000049575 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Cltb-201ENSMUST00000049575 Map3k5O35099 1380 aa26.27■■□□□ 1.8
Cltb-201ENSMUST00000049575 Trpm1Q2TV84 1622 aa26.22■■□□□ 1.79
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa26.22■■□□□ 1.79
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa26.17■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 SphkapQ6NSW3 1687 aa26.16■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nos1Q9Z0J4 1429 aa26.16■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fhod3Q76LL6 1578 aa26.16■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 Abca6Q8K441 1624 aa26.15■■□□□ 1.78
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Cltb-201ENSMUST00000049575 Afap1Q80YS6 731 aa26.13■■□□□ 1.77
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gli2Q0VGT2 1544 aa26.12■■□□□ 1.77
Cltb-201ENSMUST00000049575 Myom2Q14BI5 1463 aa26.11■■□□□ 1.77
Cltb-201ENSMUST00000049575 Talpid3E9PV87 1520 aa26.09■■□□□ 1.77
Cltb-201ENSMUST00000049575 Naip6Q9JIB6 1403 aa26.09■■□□□ 1.77
Cltb-201ENSMUST00000049575 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa26.06■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Abcc5Q9R1X5 1436 aa26.05■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fmn2Q9JL04 1578 aa26.04■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mast1Q9R1L5 1570 aa26.04■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dip2bQ3UH60 1574 aa26.03■■□□□ 1.76
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mtus2Q3UHD3 1353 aa26.01■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 Scn4aQ9ER60 1841 aa26■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 Trpm2Q91YD4 1506 aa25.99■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa25.99■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 Topaz1E5FYH1 1653 aa25.99■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 RictorQ6QI06 1708 aa25.98■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 Plekhh2Q8C115 1491 aa25.98■■□□□ 1.75
Cltb-201ENSMUST00000049575 Abca17E9PX95 1733 aa25.94■■□□□ 1.74
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kif3bQ61771 747 aa25.94■■□□□ 1.74
Cltb-201ENSMUST00000049575 Prdm16A2A935 1275 aa25.93■■□□□ 1.74
Cltb-201ENSMUST00000049575 Uggt2E9Q4X2 1504 aa25.92■■□□□ 1.74
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cabp1Q9JLK7 227 aa25.91■■□□□ 1.74
Cltb-201ENSMUST00000049575 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 134.8 ms