RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 SNHG28P0DPA3 235 aa35.6■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 CLEC4DQ8WXI8 215 aa35.6■■■■□ 3.29
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ALYREF-202ENST00000505490 GBF1Q92538 1859 aa35.59■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 PDHBP11177 359 aa35.59■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa35.59■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 TTC14Q96N46 770 aa35.59■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 MTMR7Q9Y216 660 aa35.59■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 CHD7Q9P2D1 2997 aa35.59■■■■□ 3.29
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ALYREF-202ENST00000505490 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
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ALYREF-202ENST00000505490 WDR11Q9BZH6 1224 aa35.55■■■■□ 3.28
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ALYREF-202ENST00000505490 CCDC171Q6TFL3 1326 aa35.54■■■■□ 3.28
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ALYREF-202ENST00000505490 TOMM22Q9NS69 142 aa35.53■■■■□ 3.28
ALYREF-202ENST00000505490 POLR3EQ9NVU0 708 aa35.53■■■■□ 3.28
ALYREF-202ENST00000505490 CCL23P55773 120 aa35.52■■■■□ 3.28
ALYREF-202ENST00000505490 RNF207Q6ZRF8 634 aa35.51■■■■□ 3.28
ALYREF-202ENST00000505490 TBC1D10CQ8IV04 446 aa35.51■■■■□ 3.28
ALYREF-202ENST00000505490 DNERQ8NFT8 737 aa35.51■■■■□ 3.28
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ALYREF-202ENST00000505490 CPT1AP50416 773 aa35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 HAND2P61296 217 aa35.5■■■■□ 3.27
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ALYREF-202ENST00000505490 OTOP2Q7RTS6 562 aa35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 MAF1Q9H063 256 aa35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 PRDM12Q9H4Q4 367 aa35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 MSRAQ9UJ68 235 aa35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 LAMA4Q16363 1823 aa35.49■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP35.49■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa35.49■■■■□ 3.27
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ALYREF-202ENST00000505490 ADGRE1Q14246 886 aa35.49■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 MFSD6Q6ZSS7 791 aa35.49■■■■□ 3.27
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ALYREF-202ENST00000505490 SMC5Q8IY18 1101 aa35.47■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 TNKSO95271 1327 aa35.47■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 PFKMP08237 780 aa35.46■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 OR6J1Q8NGC5 347 aa35.46■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa35.46■■■■□ 3.27
ALYREF-202ENST00000505490 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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ALYREF-202ENST00000505490 NBPF20Q3BBV1 942 aa35.42■■■■□ 3.26
ALYREF-202ENST00000505490 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
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ALYREF-202ENST00000505490 TRANK1O15050 2925 aa35.41■■■■□ 3.26
ALYREF-202ENST00000505490 RAD50Q92878 1312 aa35.41■■■■□ 3.26
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