RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424733.1

TTC3-AS1-201, TTC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC3-AS1, Length 1,097 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NUP43Q8NFH3 380 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SAMD9Q5K651 1589 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MROH2AA6NES4 1674 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TNFRSF10CO14798 259 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NCKAP1LP55160 1127 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 APOBRQ0VD83 1088 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RPTNQ6XPR3 784 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SP8Q8IXZ3 490 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PWWP2AQ96N64 755 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 JMJD8Q96S16 334 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GGT7Q9UJ14 662 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.9□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.9□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MCM4P33991 863 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RTP2Q5QGT7 225 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SLC9A7Q96T83 725 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PRXQ9BXM0 1461 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF165P49910 485 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PRR13Q9NZ81 148 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ABCA6Q8N139 1617 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SHOXO15266 292 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MSL3P1P0C860 447 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 C9IYK1 514 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GSNP06396 782 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CELA3BP08861 270 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ERCC3P19447 782 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NFKB2Q00653 900 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MVKQ03426 396 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NKD1Q969G9 470 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZMYM3Q14202 1370 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FFAR3O14843 346 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GSTM1P09488 218 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ACRP10323 421 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LIMS1P48059 325 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MAPKAPK2P49137 400 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TEPSINQ96N21 525 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NR1I3Q14994 352 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NAT16Q8N8M0 369 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MED14O60244 1454 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 H0Y8X5 98 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CCDC27Q2M243 656 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GGNQ86UU5 652 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 AFAP1Q8N556 730 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 A0A1W2PQ27 194 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 A0A1W2PQ64 194 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 A0A1W2PQC6 194 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 A0A1W2PQD8 194 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DBHP09172 617 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms