RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	STE3	P06783	470 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	SPS22	P25380	463 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	CAF4	P36130	643 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YBL029W	P38201	376 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	GIC1	P38785	314 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	PIK1	P39104	1066 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ECM1	P39715	212 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	MPS3	P47069	682 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YDR476C	Q03362	224 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ARG7	Q04728	441 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	HPF1	Q05164	967 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	SGT1	Q08446	395 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	FAB1	P34756	2278 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	REC107	P21651	314 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	VPS34	P22543	875 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YSR3	P23501	404 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.66	□□□□□ -0.7	not detected
DDR2	YOL052C-A	SDH3	P33421	198 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	PPX1	P38698	397 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	MDM34	P53083	459 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	NPY1	P53164	384 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YGR015C	P53208	328 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	HST3	P53687	447 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	RAD34	Q06665	692 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	OPI10	Q08202	246 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	VPS68	Q12016	184 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	PST1	Q12355	444 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ATP6	P00854	259 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	OCA4	P25366	362 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	CSM1	P25651	190 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ZIP1	P31111	875 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	SIN4	P32259	974 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	ATP11	P32453	318 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	GIP1	P38229	639 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	BMT2	P38278	337 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	TAE1	P38340	232 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	DMA1	P38823	416 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	FMO1	P38866	432 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	STB2	P46679	850 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YJR149W	P47177	404 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	YNL260C	P53846	198 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	DYN3	Q04949	312 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	PSR1	Q07800	427 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	TRM8	Q12009	286 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	IOC2	Q12072	812 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
DDR2	YOL052C-A	HTA2	P04912	132 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	ATP7	P30902	174 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	MED8	P38304	223 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YEL073C	P39974	107 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	MDJ2	P42834	146 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	BIR1	P47134	954 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	GTO1	P48239	356 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YNR014W	P53719	212 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	SMA1	Q02651	245 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	ECM11	Q04110	302 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YDR124W	Q04608	324 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	GGA1	Q06336	557 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	CLN2	P20438	545 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	SOL2	P37262	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	IMA5	P40884	581 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YGL176C	P46945	554 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	DIA3	P52290	468 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	NBP35	P52920	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	IRC15	Q02733	499 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	MMT1	Q03218	510 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	HFD1	Q04458	532 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	ATG26	Q06321	1198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YMR084W	A2P2R3	262 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	TPK2	P06245	380 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	PHO81	P17442	1178 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	SAN1	P22470	610 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	TFC1	P32367	649 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	STE14	P32584	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	HES1	P35843	434 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
DDR2	YOL052C-A	GIP4	P39732	760 aa		10.62	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms