RNA–Protein interactions for RNA: YKL224C

PAU16, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene PAU16, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAU16	YKL224C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	DMA1	P38823	416 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	SAE2	P46946	345 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	HST2	P53686	357 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	GIC2	Q06648	383 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	ATG29	Q12092	213 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	YPR022C	Q12139	1133 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	SEC62	P21825	274 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	MNL1	P38888	796 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	VRG4	P40107	337 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	MAD1	P40957	749 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	STB2	P46679	850 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.24	□□□□□ -0.77	not detected
PAU16	YKL224C	BOL2	P53082	120 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	COG6	P53959	839 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	DFG5	Q05031	458 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	CDA1	Q06702	301 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	MCM16	Q12262	181 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	SPO16	P17122	198 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	AMS1	P22855	1083 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	BEM3	P32873	1128 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	MEP1	P40260	492 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	YJR149W	P47177	404 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	BUD32	P53323	261 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	GOT1	Q03554	138 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	VTI1	Q04338	217 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	ROY1	Q04847	553 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	CRN1	Q06440	651 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	ATG23	Q06671	453 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	CDC9	P04819	755 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	HOM3	P10869	527 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	PEP5	P12868	1029 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	UBX3	Q12229	455 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	GPA2	P10823	449 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	CPR3	P25719	182 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	SRB5	P32585	307 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	MUP3	P38734	546 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	CHS7	P38843	316 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	GGC1	P38988	300 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	NDE1	P40215	560 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	YNL320W	P42840	284 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	CLD1	P53264	445 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	REH1	Q06709	432 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAU16	YKL224C	COX1	P00401	534 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	BAS1	P22035	811 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	CAB3	P36076	571 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	MET30	P39014	640 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	AZF1	P41696	914 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	KXD1	P53158	218 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	TAF12	Q03761	539 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	BCH1	Q05029	724 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	MDM30	Q05930	598 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	HEM15	P16622	393 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	ADH7	P25377	361 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	KAR4	P25583	335 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	ADE1	P27616	306 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	PTM1	P32857	523 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	RRN10	P38204	145 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	AXL2	P38928	823 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	NDC80	P40460	691 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	NNF2	P53253	936 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	YMR027W	Q04371	470 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	RGT2	Q12300	763 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	MXR2	P25566	168 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	MKK2	P32491	506 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	KAP122	P32767	1081 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	SDH3	P33421	198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	YIL152W	P40455	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	MDM34	P53083	459 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	SLT2	Q00772	484 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	TPP1	Q03796	238 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	SPO20	Q04359	397 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	STE3	P06783	470 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	CYT1	P07143	309 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	RSR1	P13856	272 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	AAD3	P25612	363 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PAU16	YKL224C	NAM9	P27929	486 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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