RNA–Protein interactions for RNA: YGL207W

SPT16, Transcript of Subunit of the heterodimeric FACT complex (Spt16p-Pob3p), yeastyeast

Gene SPT16, Length 3,108 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT16YGL207W SLT2Q00772 484 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W KRE28Q04431 385 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YDR222WQ04925 415 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W ADY4Q05955 493 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W THI21Q08975 551 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W VIK1Q12045 647 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W ZRT2Q12436 422 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W ARP6Q12509 438 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W SEC39Q12745 709 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W TY3B-GQ99315 1547 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W GPA1P08539 472 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MAE1P36013 669 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W VID24P38263 362 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W WSS1P38838 269 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W GLO1P50107 326 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W PKP2P53170 491 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W OKP1P53298 406 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W USA1Q03714 838 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W DFG5Q05031 458 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W AFI1Q99222 893 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MET5P47169 1442 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CBP1P07252 654 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YEL076C-AP0CX16 216 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YLR464WP0CX17 216 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W REV1P12689 985 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RBK1P25332 333 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W PBN1P25580 416 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CWP1P28319 239 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W SEC65P29478 273 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MDL2P33311 773 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W GIP1P38229 639 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W BMT2P38278 337 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W EHT1P38295 451 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YBR287WP38355 427 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W PRE3P38624 215 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YHR122WP38829 231 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YEL076CP39971 216 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RSM26P47141 266 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W KAP114P53067 1004 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MND1P53102 219 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CGR1P53188 120 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W KAP120Q02932 1032 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CRF1Q04930 467 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W BMT6Q12291 365 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W NBL1Q3E7Y6 73 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YLR149CQ99296 730 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W ULS1Q08562 1619 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
SPT16YGL207W CDC23P16522 626 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W KIP1P28742 1111 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W REC104P33323 182 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YPT52P36018 234 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MRPL4P36517 319 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MRPL37P36532 105 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CDS1P38221 457 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W HOC1P47124 396 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YGR117CP53270 476 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W AQR1P53943 586 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W VPS64Q03944 604 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W CSI1Q04368 295 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W MRPL1Q04599 285 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W YLR407WQ06070 228 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W AIM6Q07716 390 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W RAX1Q08760 435 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT16YGL207W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-FP0CX63 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-CP25384 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W SEC53P07283 254 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W DOA1P36037 715 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W ALY1P36117 915 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W SLM4P38247 162 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W PHO90P39535 881 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W PSF2P40359 213 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W BNA2P47125 453 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W YGR111WP53265 400 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W IST1P53843 298 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W MUK1Q02866 612 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W CCE1Q03702 353 aa3.59□□□□□ -1.84
SPT16YGL207W HED1Q03937 162 aa3.59□□□□□ -1.84
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